Table 4.
The HD-binding cis-element in the promoters of cell-wall loosening protein genes upregulated in edt1 roots (including the genes coding for proteins that do not localize in the wall)
| Gene family | Locus | HD-binding cis-element |
|---|---|---|
| Expansin | At3g29030 | aaattaaa |
| At4g28250 | aaattaaa | |
| At2g03090 | aaattaaa | |
| At1g20190 | aaattaaa ×2 | |
| At2g20750 | aaattaaa ×2 | |
| At2g39700 | aaattaaa ×3 | |
| At3g45970 | aaattaaa, aaattagt, actaattt | |
| At1g12560a | aaattagt ×2, actaattt ×2 | |
| XTH | At2g06850 | aaattaaa ×4 |
| At2g36870 | aaattaaa ×3 | |
| At4g03210 | aaattaaa | |
| At4g30270 | aaattaaa ×3 | |
| At4g37800 | aaattaaa ×3 | |
| At5g57560 | aaattaaa, aaattagt, actaattt | |
| Pectate lyase | At1g67750 | aaattaaa ×3 |
| At4g24780 | aaattaaa ×2 | |
| At1g04680 | aaattaaa, aaattagt, actaattt | |
| At3g24670a | aaattagt ×2, actaattt ×2 | |
| Pectinesterase | At2g45220 | aaattaaa ×2, aaattagt, actaattt |
| At1g02810 | aaattaaa | |
| At5g47500 | aaattaaa, aaattagt, actaattt | |
| At3g10720 | aaattaaa | |
| Pectinase | At1g65570a | actaattt ×2, aaattagt ×2 |
| At5g14650 | aaattaaa ×2, aaattagt, actaattt | |
| At3g07970 | aaattaaa, aaattagt, actaattt | |
| PMEI | At5g62350 | aaattaaa ×3, aaattagt, actaattt |
| At1g62770 | aaattaaa | |
| At5g62360 | aaattaaa ×2 | |
| Glycosyl hydrolase | At3g60130 | aaattaaa |
| At1g51470 | aaattaaa | |
| At1g47600 | aaattaaa | |
| At3g07320 | aaattaaa | |
| At4g18340 | aaattaaa | |
| At5g63800 | aaattaaa | |
| At5g34940 | aaattaaa | |
| At5g15870 | aaattaaa | |
| At4g02290 | aaattaaa | |
| At4g19810 | aaattaaa ×2 | |
| At2g32990 | aaattaaa ×2, aaattagt ×2, actaattt ×2 | |
| At3g28180 | aaattaaa ×3, aaattagt ×2, actaattt ×2 | |
| At1g60140 | aaattaaa ×3, aaattagt, actaattt | |
| At3g60140 | aaattaaa ×4, aaattagt ×2, actaattt ×2 | |
| At1g61820 | aaattaaa ×5 | |
| At1g02640 | aaattaaa ×5 | |
| At2g27500a | aaattagt | |
| At5g49360a | aaattagt, actaattt | |
| Extensin | At4g38770 | aaattaaa |
| At4g02270 | aaattaaa | |
| At5g05500 | aaattaaa, aaattagt, actaattt | |
| At3g54580 | aaattaaa ×2 | |
| At5g49080 | aaattaaa | |
| At4g08410 | aaattaaa, aaattagt, actaattt | |
| At1g21310 | aaattaaa | |
| At5g06630 | aaattaaa | |
| At3g28550 | aaattaaa ×2, aaattagt ×2, actaattt ×2 | |
| At3g06750 | aaattaaa | |
| At1g76930 | aaattaaa ×2 | |
| At5g49280 | aaattaaa | |
| At5g09480 | aaattaaa | |
| At2g43150 | aaattaaa |
a Genes whose promoter does not contain the ‘aaattaaa’ motif.