TABLE 2.
PCR primers used in this study
| Primer name | Sequence (5′→3′)a |
|---|---|
| BamHI-traD-F | CGCGGGATCCATGAGTGCCCACTTCCCTGAAA |
| deltraKF-EcoRV | GGTGGTGATATCCGGCGGTCAATGACTGTATC |
| deltraK-XhoI-R | GGTGGTCTCGAGCGAAACTTGCCTTGCGAGAC |
| FLAG3-EcoRI-F | GGTGGTGAATTCGGTTCCGCTGGCTCCGCTGCTGG |
| FLAG3-HindIII-R | GGTGGTAAGCTTGTCCATGAAACCAACATAAGCAACTGG |
| pCK5F-SpeI | GGTGGTACTAGTGATGTGGCTGGAGCTAATCG |
| pCK5R100 | GGTGGTAAGCTTTCAGATGGCCCGTACATATTCTG |
| pCK5R200 | GGTGGTAAGCTTTCAATCAGCGGCGGTGTAACTTC |
| pCK5R-end | GGTGGTAAGCTTCCATGGCTAGCTCTCAAC |
| pMR83F1-SpeI | GGTGGTACTAGTATGATGCGTGGCACTACCG |
| pMR83F2-SpeI | GGTGGTACTAGTTACACCGCCGCTGATATGC |
| TraB-FLAGCter-F | GCCGGGTCTCCGACGACGACAAGTAGGATCCATCTATGAAAAAG |
| TraB-FLAGCter-R | GCCGGGTCTCCCGTCGTCCTTGTAGTCTTTGGTTTCGCCGGTATCAAT |
| TraB-SalI-F | GGTGGTGTCGACTATTATCAGCCGTCCGGGAG |
| TraB-XhoI-R | GGTGGTCTCGAGGTGCAGAGTGCTTCCAACAG |
| traDdel-XhoI | GCTCGAGGGCATTAATCGTGGGTATCTC |
| traD-XhoI2 | GCTCGAGGCACAATTAAGAATAAGGTATAAGCAGCT |
| traK-EcoRI-F | GCGAATTCTTGAGCAGAATCGCCATTGA |
| traK-EcoRI-R2 | GGTGGTGAATTCACCTCCCGGACGGCTGATAATAA |
| traK-endF-SalI | GGTGGTGTCGACCGTCCGGGAGGTTGAGATGAG |
| traK-FLAG3-SalI-R | AAGTAAGTTCTTGTCGACTTATTTATC |
| traK-NheI-R | GGTGGTGCTAGCTCTCAACCTCCCGGACGGCT |
| traK-R-STOP | GGTGGTCTCGAGTCAACCTCCCGGACGGCTGAT |
| traK-RBS-EcoRI | GGTGGTGAATTCCGAAGTTGAAACCGAGGAT |
| traK-RBS-SacII | GGTGGTCCGCGGCGAAGTTGAAACCGAGGAT |
| traK-SspI-F | GGTGGTAATATTAAGCAGAATCGCCATTGAAGG |
| traKstartR-SalI | GGTGGTGTCGACATCAATTACCTCGATTACCGCC |
| traK-XhoI-R | CAGCTCGAGAAATTGCACTGCCCACAATC |
| traV-EcoRI-F | CGGAATTCAACCTTAACCATGTCCGGTATC |
| traV-XhoI-R | GCTCGAGCTATCGAACGGTACCGGGAATAC |
| XhoI-traD-R | GCGCCTCGAGATTGCAAAGATTACTGAGATACCCACG |
a
Restriction sites are underlined.