TABLE 1.
Comparison of the results of the PCR described by Scheutz et al. (19) and the microarray results of selected reference strains
| Reference strain | Results of microarray | Results of PCR for stx1 |
Results of PCR for stx2 |
||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Stx1a | Stx1c | Stx1d | Stx2a | Stx2b | Stx2c | Stx2d | Stx2e | Stx2f | Stx2g | ||
| CB168_120310a | Stx1a | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| PT199_120310a | Stx1c | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − |
| DSM15856b | Stx1d | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − |
| EDL933 (ATCC 700927)c | Stx1a, Stx2a | + | − | − | + | − | − | − | − | − | − |
| 1760/98 (O129:H-)c | Stx1a, Stx2b | + | − | − | − | + | − | − | − | − | − |
| WH-01/26/021-5d | Stx1a, Stx2c | + | − | − | − | − | + | − | − | − | − |
| DD_1380/99_156_#311c | Stx1a, Stx2d | + | − | − | − | − | − | + | − | − | − |
| 12 (O128:H2)e | Stx1c, Stx2b | − | + | − | − | + | − | − | − | − | − |
| 13 (O172:H-)e | Stx1a, Stx2a, Stx2c | + | − | − | + | − | + | − | − | − | − |
| 17 (O8:H20)e | Stx1a, Stx2a, Stx2d | + | − | − | + | − | − | + | − | − | − |
| CB5805a | Stx2a | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − |
| 20 (O146:H28)e | Stx2b | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − |
| 02_23877 (O157)f | Stx2c | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − |
| CB12533a | Stx2d | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − |
| 11 (O101:H-)e | Stx2e | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − |
| T4-97g | Stx2f | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − |
| 7Vg | Stx2g | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + |
| 01_23209 (O157)f | Stx2a, Stx2c | − | − | − | + | − | + | − | − | − | − |
| 45_28154 (O174)f | Stx2a, Stx2d | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − |
| 43 (O116:H-)e | Stx2a, Stx2g | − | − | − | + | − | − | − | − | − | + |
| 21 (O2:H29)e | Stx2b, Stx2c | − | − | − | − | + | + | − | − | − | − |
a
L. Beutin, Federal Institute for Risk Assessment, Berlin, Germany.
b
Leibniz Institute DSMZ-German Collection of Microorganisms and Cell Cultures, Braunschweig, Germany.
c
F. Gunzer, Institute for Medical Microbiology and Hygiene, Dresden, Germany.
d
L. Geue, Friedrich Loeffler Institute, Jena, Germany.
e
H. Hächler, Institute for Food Safety and Food Hygiene, Zürich, Switzerland.
f
E. Bingen, Service de Microbiology, Paris, France.
g
H. Karch/M. Bielaszewska, Institute for Hygiene, Münster, Germany.