Table 2. P. westermani mtDNA annotations showing PCGs and tRNA in dot bracket format.
Name | Start | Stop | Strand | Length | Structure |
---|---|---|---|---|---|
cox3 | 658 | 1134 | + | 477 | |
trnH(gtg) | 1147 | 1209 | + | 63 | (((((((..((((......)))).(((((.......)))))....((.(..).))))))))). |
cob-a | 1213 | 1860 | + | 648 | |
cob-b | 1922 | 2311 | + | 390 | |
nad4l | 2393 | 2644 | + | 252 | |
nad4_0-a | 2922 | 3167 | + | 246 | |
nad4_0-b | 3163 | 3465 | + | 303 | |
nad4_1-b | 3564 | 3710 | − | 147 | |
nad4_1-a | 3725 | 3805 | − | 81 | |
trnQ(—) | 3882 | 3944 | + | 63 | (((((((..((((......)))).(((((......)))))....((.......))))))))). |
trnF(gaa) | 3951 | 4020 | + | 70 | ((((.((..((((........)))).(((((.......)))))....(((.........))))).)))). |
trnM(cat) | 4027 | 4092 | + | 66 | (((((((..((((........)))).(((((.......)))))....((((...))))))))))). |
atp6 | 4326 | 4583 | + | 258 | |
nad2 | 4627 | 5262 | + | 636 | |
trnV(tac) | 5470 | 5531 | + | 62 | (((((.(..((((.....)))).(((((.......)))))....(((....)))).))))). |
trnA(tgc) | 5539 | 5610 | + | 72 | (((((((..((((............)))).(((((.......)))))....(((((...)))))))))))). |
trnD(gtc) | 5615 | 5681 | + | 67 | (((((((..((((.........)))).(((((.......)))))....(((.....)))))))))). |
nad1-a | 5767 | 5877 | + | 111 | |
nad1-b | 6077 | 6535 | + | 459 | |
trnN(gtt) | 6606 | 6675 | + | 70 | (((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.....)))))))))))). |
trnP(tgg) | 6676 | 6743 | + | 68 | ((((.(((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((.......)))))))))). |
trnI(gat) | 6749 | 6812 | + | 64 | ((((((.(..((((....)))).(((((.......)))))....(((((..)))))))))))). |
trnK(ctt) | 6815 | 6880 | + | 66 | (((((((..((((......)))).(((((.......)))))....(((((...)))))))))))). |
nad3 | 7001 | 7231 | + | 231 | |
trnS1(gct) | 7244 | 7302 | + | 59 | (((((((.......(((((.......)))))....(((((......)))))))))))). |
trnW(tca) | 7308 | 7375 | + | 68 | (((((((..((((......)))).(((((.......)))))....((((.......))))))))))). |
cox1 | 7379 | 8872 | + | 1494 | |
trnT(tgt) | 8914 | 8977 | + | 64 | ((((((...((((.......)))).(((((.......)))))....(((....))).)))))). |
rrnL | 9067 | 9181 | + | 115 | ((...((((((((.....((.(((((((.((((...))))... ((..(((((.....)))))..))..).)))))).))....((.....)).......))))))))......)) |
rrnL | 9417 | 9951 | + | 535 | .................(((....)))....(.....)..................((................)).. ((....))..........................................((...................(...)...... (((........))).....))..........((((((........))))))...... (((.(((.((..... ((((((((((((.(((((...)))))..((((...)))).((.............))......... ((((...)))).....)))))..))))))).......((((((((((((... ((.......))...))))))))).))).........(((((.((((((..(((.((((((......)))))).))).. (((((.....)))))....)))))..)...))))).....(((((((....))).))))....))..)))))).... ((...............))........... |
trnC(gca) | 9961 | 10025 | + | 65 | (((((((..((((...))))...(((((.......)))))....(((((...)))))))))))). |
rrnS | 10028 | 10751 | + | 724 | ...(((((.......))))).(((((((...((((((((....((..(....)....... (((.................. (((..((...)).))).))))).....(((.(..(((((....))))))))).))))))))... ((((((((..................)))...............))))))))))))....((((.....((((.(. (((..........(((...((......))...)))............((....))...))).).))))....(((((... ((((.........))))...))))).............)))).((((....))))........((((. ((((((((.......(((((..((((((((((....(((........))).........(((((((.....((.((.. ((((((((((....(((.....(....). ((....)).)))..............))).)))...))))))))....))))))).)).))))))))............. (((((..........)))))..........)))))..... ((((((...........))))))...........)))))))))).))..............((. (((....))).))................(((((((.((....)).)))))))........... |
cox2-a | 11020 | 11094 | + | 75 | |
cox2-b | 11112 | 11204 | + | 93 | |
cox2-c | 11201 | 11338 | + | 138 | |
nad6 | 11410 | 11772 | + | 363 | |
trnY(gta) | 11814 | 11876 | + | 63 | .((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....((((.)))))))))).. |
trnL1(tag) | 11883 | 11947 | + | 65 | .((((((..(((.......))).(((((.......)))))....(((.(...).))))))))).. |
trnL2(—) | 12025 | 12086 | + | 62 | (((((((..(((.......))).((((........))))....(((((.)))))))))))). |
trnR(tcg) | 12091 | 12154 | + | 64 | (((((((((......)))).(((((.......)))))....(((((.......)))))))))). |
nad5_0-a | 12430 | 12927 | + | 498 | |
nad5_0-b | 12989 | 13285 | + | 297 | |
nad5_1 | 13506 | 13733 | + | 228 | |
trnG(tcc) | 13751 | 13820 | + | 70 | (((((((..((((..........)))).(((.(.......).)))....((((.....))))))))))). |
trnE(ttc) | 14358 | 14422 | + | 65 | (((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....((((...))))))))))). |