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. 2014 Aug 12;2:e484. doi: 10.7717/peerj.484

Table 2. P. westermani mtDNA annotations showing PCGs and tRNA in dot bracket format.

Name Start Stop Strand Length Structure
cox3 658 1134 + 477
trnH(gtg) 1147 1209 + 63 (((((((..((((......)))).(((((.......)))))....((.(..).))))))))).
cob-a 1213 1860 + 648
cob-b 1922 2311 + 390
nad4l 2393 2644 + 252
nad4_0-a 2922 3167 + 246
nad4_0-b 3163 3465 + 303
nad4_1-b 3564 3710 147
nad4_1-a 3725 3805 81
trnQ(—) 3882 3944 + 63 (((((((..((((......)))).(((((......)))))....((.......))))))))).
trnF(gaa) 3951 4020 + 70 ((((.((..((((........)))).(((((.......)))))....(((.........))))).)))).
trnM(cat) 4027 4092 + 66 (((((((..((((........)))).(((((.......)))))....((((...))))))))))).
atp6 4326 4583 + 258
nad2 4627 5262 + 636
trnV(tac) 5470 5531 + 62 (((((.(..((((.....)))).(((((.......)))))....(((....)))).))))).
trnA(tgc) 5539 5610 + 72 (((((((..((((............)))).(((((.......)))))....(((((...)))))))))))).
trnD(gtc) 5615 5681 + 67 (((((((..((((.........)))).(((((.......)))))....(((.....)))))))))).
nad1-a 5767 5877 + 111
nad1-b 6077 6535 + 459
trnN(gtt) 6606 6675 + 70 (((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.....)))))))))))).
trnP(tgg) 6676 6743 + 68 ((((.(((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((.......)))))))))).
trnI(gat) 6749 6812 + 64 ((((((.(..((((....)))).(((((.......)))))....(((((..)))))))))))).
trnK(ctt) 6815 6880 + 66 (((((((..((((......)))).(((((.......)))))....(((((...)))))))))))).
nad3 7001 7231 + 231
trnS1(gct) 7244 7302 + 59 (((((((.......(((((.......)))))....(((((......)))))))))))).
trnW(tca) 7308 7375 + 68 (((((((..((((......)))).(((((.......)))))....((((.......))))))))))).
cox1 7379 8872 + 1494
trnT(tgt) 8914 8977 + 64 ((((((...((((.......)))).(((((.......)))))....(((....))).)))))).
rrnL 9067 9181 + 115 ((...((((((((.....((.(((((((.((((...))))...
((..(((((.....)))))..))..).)))))).))....((.....)).......))))))))......))
rrnL 9417 9951 + 535 .................(((....)))....(.....)..................((................))..
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((...............))...........
trnC(gca) 9961 10025 + 65 (((((((..((((...))))...(((((.......)))))....(((((...)))))))))))).
rrnS 10028 10751 + 724 ...(((((.......))))).(((((((...((((((((....((..(....)....... (((..................
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cox2-a 11020 11094 + 75
cox2-b 11112 11204 + 93
cox2-c 11201 11338 + 138
nad6 11410 11772 + 363
trnY(gta) 11814 11876 + 63 .((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....((((.))))))))))..
trnL1(tag) 11883 11947 + 65 .((((((..(((.......))).(((((.......)))))....(((.(...).)))))))))..
trnL2(—) 12025 12086 + 62 (((((((..(((.......))).((((........))))....(((((.)))))))))))).
trnR(tcg) 12091 12154 + 64 (((((((((......)))).(((((.......)))))....(((((.......)))))))))).
nad5_0-a 12430 12927 + 498
nad5_0-b 12989 13285 + 297
nad5_1 13506 13733 + 228
trnG(tcc) 13751 13820 + 70 (((((((..((((..........)))).(((.(.......).)))....((((.....))))))))))).
trnE(ttc) 14358 14422 + 65 (((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....((((...))))))))))).