Skip to main content
. 2014 Aug 25;9(8):e105757. doi: 10.1371/journal.pone.0105757

Table 3. Association mapping of the OC trait using GLM method under the 5 environments.

Marker 2011 2012
Pingyu Yuanyang Pingyu Yuanyang Xinyang
Fmaker P marker R2 Fmaker P marker R2 Fmaker P marker R2 Fmaker P marker R2 Fmaker P marker R2
Hs345 35.93 3.05E-25 0.28 26.22 4.37E-19 0.22 13.41 3.41E-10 0.13 26.44 3.11E-19 0.22 37.34 4.08E-26 0.29
Hs4381 61.72 8.30E-24 0.25 43.17 1.48E-17 0.19 40.31 1.53E-16 0.18 46.18 1.32E-18 0.20 75.46 3.73E-28 0.29
Hs1956 47.51 7.46E-19 0.22 39.98 2.83E-16 0.19 16.15 2.05E-07 0.09 24.86 8.80E-11 0.13 40.25 2.29E-16 0.19
Hs485 31.50 4.06E-18 0.20 20.63 2.29E-12 0.14 21.10 1.27E-12 0.15 21.48 7.82E-13 0.15 36.07 1.98E-20 0.23
Hs1036 41.73 6.75E-17 0.20 25.69 4.19E-11 0.13 17.87 4.24E-08 0.10 26.00 3.19E-11 0.13 43.84 1.24E-17 0.20
Hs205 17.18 3.11E-15 0.19 10.41 2.42E-09 0.12 10.37 2.68E-09 0.13 12.46 3.65E-11 0.15 16.29 1.75E-14 0.18
Hs4209 14.91 2.67E-13 0.17 8.15 2.64E-07 0.10 9.28 2.55E-08 0.12 12.37 4.41E-11 0.14 23.92 9.21E-21 0.25
Hs672 16.81 1.19E-12 0.16 11.35 1.09E-08 0.11 16.82 1.16E-12 0.16 20.27 4.38E-15 0.18 26.53 2.58E-19 0.22
Hs393 17.90 2.01E-13 0.16 10.10 9.18E-08 0.10 12.19 2.61E-09 0.12 16.74 1.32E-12 0.15 29.18 4.76E-21 0.24
Hs4061 30.93 3.93E-13 0.14 19.32 1.06E-08 0.09 21.42 1.60E-09 0.11 23.28 3.05E-10 0.11 30.72 4.66E-13 0.14
Y2129 22.99 4.73E-10 0.13 13.89 1.64E-06 0.08 15.29 4.57E-07 0.09 24.86 9.25E-11 0.13 30.65 6.69E-13 0.16
Hs618 25.22 5.54E-11 0.12 12.90 3.86E-06 0.06 7.54 6.19E-04 0.04 17.66 4.78E-08 0.09 22.91 4.26E-10 0.11
Hs377 4.14 2.01E-05 0.11 3.16 6.87E-04 0.08 3.92 4.49E-05 0.10 6.26 7.83E-09 0.15 7.09 3.63E-10 0.17
Hs635 22.15 8.38E-10 0.11 17.23 7.11E-08 0.08 10.34 4.30E-05 0.05 18.79 1.71E-08 0.09 31.73 1.98E-13 0.15
Hs02 20.98 2.38E-09 0.10 17.19 7.34E-08 0.08 10.31 4.43E-05 0.05 12.41 6.09E-06 0.06 36.20 4.55E-15 0.16
Hs376 19.25 1.15E-08 0.10 11.49 1.45E-05 0.06 12.53 5.52E-06 0.07 16.27 1.72E-07 0.08 21.26 1.89E-09 0.10
Hs1638 17.45 6.23E-08 0.09 7.29 7.96E-04 0.04 18.27 2.97E-08 0.10 19.25 1.23E-08 0.10 24.86 8.66E-11 0.13
Hs586 16.84 1.01E-07 0.08 13.48 2.25E-06 0.07 7.30 7.82E-04 0.04 10.90 2.52E-05 0.06 20.14 5.06E-09 0.10
Hs4082 8.18 3.36E-04 0.04 7.56 6.08E-04 0.04 18.30 2.69E-08 0.09 15.51 3.44E-07 0.08 20.61 3.33E-09 0.10

The markers associated with the OC trait under 5 environments are listed in the table.