Skip to main content
. 2014 Aug 25;9(8):e105757. doi: 10.1371/journal.pone.0105757

Table 4. Association mapping of PC trait using GLM method under the 5 environments.

Marker 2011 2012
Pingyu Yuanyang Pingyu Yuanyang Xinyang
Fmaker P marker R2 Fmaker P marker R2 Fmaker P marker R2 Fmaker P marker R2 Fmaker P marker R2
Hs345 25.46 1.41E-18 0.21 21.52 6.24E-16 0.19 13.41 3.41E-10 0.13 26.44 3.11E-19 0.22 37.34 4.08E-26 0.29
Hs4381 50.30 5.14E-20 0.21 33.86 3.25E-14 0.15 40.31 1.53E-16 0.18 46.18 1.32E-18 0.20 75.46 3.73E-28 0.29
Hs485 26.93 9.51E-16 0.18 21.07 1.32E-12 0.14 21.10 1.27E-12 0.15 21.48 7.82E-13 0.15 36.07 1.98E-20 0.23
Hs205 16.43 1.33E-14 0.18 7.90 4.52E-07 0.10 10.37 2.68E-09 0.13 12.46 3.65E-11 0.15 16.29 1.75E-14 0.18
Hs1036 31.71 2.48E-13 0.16 17.49 5.98E-08 0.09 17.87 4.24E-08 0.10 26.00 3.19E-11 0.13 43.84 1.24E-17 0.20
Hs393 16.01 4.43E-12 0.15 13.34 3.73E-10 0.12 12.19 2.61E-09 0.12 16.74 1.32E-12 0.15 29.18 4.76E-21 0.24
Hs672 17.02 8.43E-13 0.15 11.63 6.73E-09 0.11 16.82 1.16E-12 0.16 20.27 4.38E-15 0.18 26.53 2.58E-19 0.22
Hs1956 26.91 1.50E-11 0.14 22.88 4.93E-10 0.12 16.15 2.05E-07 0.09 24.86 8.80E-11 0.13 40.25 2.29E-16 0.19
Hs377 5.73 5.69E-08 0.14 4.46 6.21E-06 0.11 3.92 4.49E-05 0.10 6.26 7.83E-09 0.15 7.09 3.63E-10 0.17
Y2129 26.65 1.99E-11 0.14 16.79 1.17E-07 0.09 15.29 4.57E-07 0.09 24.86 9.25E-11 0.13 30.65 6.69E-13 0.16
Hs4209 11.18 5.03E-10 0.13 7.07 2.56E-06 0.09 9.28 2.55E-08 0.12 12.37 4.41E-11 0.14 23.92 9.21E-21 0.25
Hs4061 25.55 4.14E-11 0.12 17.49 5.59E-08 0.08 21.42 1.60E-09 0.11 23.28 3.05E-10 0.11 30.72 4.66E-13 0.14
Hs1638 20.72 3.30E-09 0.11 14.13 1.29E-06 0.08 18.27 2.97E-08 0.10 19.25 1.23E-08 0.10 24.86 8.66E-11 0.13
Hs618 22.58 5.71E-10 0.11 12.16 7.75E-06 0.06 7.54 6.19E-04 0.04 17.66 4.78E-08 0.09 22.91 4.26E-10 0.11
Hs1514 19.02 1.53E-08 0.10 15.50 3.69E-07 0.08 6.23 2.20E-03 0.04 14.59 8.48E-07 0.08 14.77 7.19E-07 0.08
Hs4089 19.68 7.67E-09 0.09 18.49 2.25E-08 0.09 6.44 1.80E-03 0.03 17.68 4.71E-08 0.09 13.84 1.61E-06 0.07
Hs425 17.07 8.21E-08 0.08 8.38 2.75E-04 0.04 7.90 4.39E-04 0.04 17.02 8.55E-08 0.08 18.86 1.61E-08 0.09
Hs560 4.53 1.96E-04 0.07 4.98 6.48E-05 0.08 4.69 1.33E-04 0.07 6.43 1.91E-06 0.10 7.36 1.97E-07 0.11
Hs635 13.54 2.12E-06 0.07 13.28 2.72E-06 0.07 10.34 4.30E-05 0.05 18.79 1.71E-08 0.09 31.73 1.98E-13 0.15
Hs02 14.67 7.44E-07 0.07 10.16 5.08E-05 0.05 10.31 4.43E-05 0.05 12.41 6.09E-06 0.06 36.20 4.55E-15 0.16
Hs4265 5.17 1.34E-04 0.06 6.58 7.07E-06 0.08 6.70 5.50E-06 0.08 8.54 1.16E-07 0.10 11.90 1.13E-10 0.14
Hs376 11.29 1.76E-05 0.06 11.04 2.22E-05 0.06 12.53 5.52E-06 0.07 16.27 1.72E-07 0.08 21.26 1.89E-09 0.10
Hs586 11.07 2.15E-05 0.06 11.38 1.60E-05 0.06 7.30 7.82E-04 0.04 10.90 2.52E-05 0.06 20.14 5.06E-09 0.10
Hs4082 12.36 6.41E-06 0.06 8.72 2.00E-04 0.04 18.30 2.69E-08 0.09 15.51 3.44E-07 0.08 20.61 3.33E-09 0.10

The markers associated with the PC trait under 5 environments are listed in the table.