Table 1. Sequencing alignment statistics.

Dataset	Number of aligned read pairs	Percentage of reads aligned to
		C/D snoRNA	H/ACA snoRNA	scaRNA	miRNA	snRNA	YRNA	tRNA	rRNA
SKOV3ip1 rep1	16660014	50	0.82	0.13	12	0.13	0.14	2.6	29
SKOV3ip1 rep2	14925302	52	0.82	0.12	12	0.14	0.15	2.0	28
MCF7 rep1	21538622	53	0.79	0.28	6.1	0.089	0.16	1.4	35
MCF7 rep2	19362058	54	0.78	0.27	5.7	0.092	0.15	1.4	35
BJ-Tielf rep1	17557177	56	0.95	0.16	9.9	0.095	0.24	5.9	27
BJ-Tielf rep2	17373969	54	0.95	0.17	10	0.084	0.23	5.9	29
INOF rep1	16716777	37	0.59	0.11	14	0.099	0.20	2.9	42
INOF rep2	16663938	38	0.63	0.12	14	0.097	0.19	2.7	40