Table 3.
Specificity of the m-PCR
| Bacterial strain | Source | Genes | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| mdh | eaeA | bfp | stx1 | stx2 | ial | lt | gapdh | st | eagg | astA | ||
| Commensal E. coli | NHLS | + | − | − | − | − | − | + | − | − | − | |
| Enterohaemorrhagic E. coli | NHLS | + | + | − | + | + | − | − | + | − | − | − |
| Enteropathogenic E. coli | NHLS | + | + | + | − | − | − | − | + | − | − | + |
| Enteroaggregative E. coli | NHLS | + | − | − | − | − | − | − | + | − | + | − |
| Enterotoxigenic E. coli | NHLS | + | − | − | − | − | − | + | + | + | − | − |
| Enteroinvasive E. coli | NHLS | + | − | − | − | − | + | − | + | − | − | − |
| Shigella dysenteriae serovar type 1 | NHLS | + | − | − | − | − | + | − | + | − | − | − |
| Shigella dysenteriae serovar type 2 | NHLS | + | − | − | − | − | + | − | + | − | − | − |
| Shigella boydii serovar B | NHLS | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − |
| Shigella flexneri | NHLS | + | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − |
| Shigella sonnei | NHLS | + | + | − | − | − | + | − | + | − | − | − |
| Vibrio cholerae non-O1 | NHLS | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − |
| Vibrio cholerae O1 | NTCC | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − |
| Vibrio cholerae O1 | NTCC | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − |
| Vibrio parahaemolyticus | NHLS | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − |
| Vibrio parahaemolyticus | NCTC | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − |
| Vibrio cholerae O139 | NHLS | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − |
| Vibrio cholerae Ogawa | NHLS | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − |
| Vibrio mimicus | NHLS | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − |
| Vibrio fluvialis | NCTC | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − |
| Vibrio furnissii | ATCC | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − |
| Salmonella enterica serovar Typhi salty O1 | NHLS | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − |
| Salmonella enterica serovar Typhimurium saltm O1 | NHLS | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − |
| Salmonella enterica serovar Typhimurium saltm O2 | NHLS | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − |
| Salmonella enterica serovar Typhi salty O2 | NHLS | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − |
| Salmonella enterica serovar Paratyphi | NHLS | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − |
| Salmonella enterica serovar Paratyphi A | NHLS | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − |
| Salmonella enterica serovar Paratyphi C | NHLS | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − |
| Salmonella Gallinarum | NHLS | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − |
| Salmonella enterica serovar Enteritidis | NHLS | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − |
| Pseudomonas aeruginosa | NHLS | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − |
| Klebsiella pneumonia | NHLS | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − |
| Bacillus subtilis | NHLS | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − |
| Bacillus cereus | NHLS | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − |
| Aeromonas veronii | ATCC | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − |
| Enterococcus faecium | NHLS | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − |
| Enterococcus faecalis | NHLS | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − |
| Morganella morgannii | NHLS | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − |