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. 2014 Aug 28;14:205. doi: 10.1186/s12866-014-0205-7

Table 1.

Distribution of C. jejuni gyrA alleles by source and conserved nucleotide

Peptide group Allele no.* Nucleotide position Distribution by source** No. of ST
64 111 210 257 276 324 408 438 486 SW DM P
1 A G C C G A G C A 26 27 22 26
4 . . . . . . . . . 2 14 6 6
5 . . . . . . . . . 3 12 10 11
7 . . . . . . . . . 45 8 16 11
11 . . . . . . A . . 26 10 22
12 . . . . . . . . . 1 1
13 . . . . . . . . . 3 4 5
16 . . . . . . . . . 4 2
18 . . . . . . . . . 1 1
19 . . . . . . . . . 6 1
31 . . . . . . . . . 22 1 11
1 36 . . . . . . . . . 5 5
39 . . . . . . A . . 1 1
40 . . . . . . A . . 13 8
41 . . . . . . A . . 3 3
56 . . . . . . A . . 3 2
66 . . . . . . A . . 1 1
73 . . . . . . . . . 1 1
74 . . . . . . . . . 1 1
75 . . T . . . . . . 1 1
76 . . . . . . . . . 2 1
79 . . . . . . A . . 1 1
80 . . . . . . . . . 1 1
2 . . . T . . . . . 3 3
3 . . . T . . . . . 9 3 6 9
8 . . . T . . . . . 14 17 13 14
2 15 . . . T . . . . . 2 2
17 . . . T . . . . . 2 2
30 . . . T . . . . . 3 1 4
44 . . . T . . . . . 2 2
3 6 G . . . . . . . . 1 1
9 G . . T . . . . . 2 2 20 11
4 53 G . . T . . . . . 1 1
78 G . . T . . . . . 1 1
10 G . . . . . . . . 7 4 6 10
5 23 G . . . . . . . . 1 1
27 G . . . . . . . . 1 1
6 14 . . . . . . . . . 1 1
8 24 G . . T . . . . . 1 1 2
14 54 . A T . A G A T G 1 1
55 . A T . A G A T G 2 1
301 301 . T T . A . . A . 1 1

*Nucleotide allele number, **SW = Surface water, DM = Domesticated Mammals, P = Poultry.