. 2014 Aug 28;14:205. doi: 10.1186/s12866-014-0205-7

Table 2.

Distribution of C. coli gyrA alleles by source and conserved nucleotide

Peptide group*	Allele no.	Nucleotide position																				Distribution by source**			No. of ST
Peptide group*	Allele no.	21	69	78	81	90	144	177	180	195	257	267	273	276	279	300	414	417	435	477	495	SW	DM	P	No. of ST
	301	A	T	T	T	C	C	C	A	A	C	C	C	A	A	T	A	C	G	C	G	1	2	9	11
	308	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	4	2	14	10
	309	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2	11	1	8
301 A	312	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1	1	2	4
	316	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	4	10	10	18
	321	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		2		1
	318	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	5	5	5	8
	323	.	.	.	.	.	.	G	.	.	.	T	.	G	.	A	G	T	.	T	.	16			10
	324	.	.	.	.	.	.	G	G	.	.	T	.	G	.	A	G	T	.	T	.	1			1
	325	.	.	.	.	.	.	G	.	.	.	T	.	G	.	A	G	T	.	T	.	13			10
	327	.	.	.	.	.	.	G	.	.	.	T	.	G	.	A	G	T	.	T	.	6			3
301 B	334	.	.	.	.	.	.	G	.	.	.	T	.	G	.	A	G	T	.	T	.	2			2
	342	.	.	.	.	.	.	G	.	.	.	T	.	G	.	A	G	T	.	T	.	2			1
	346	.	.	.	.	.	.	G	.	.	.	T	.	G	.	A	G	T	.	T	.	2			2
	349	.	.	.	.	.	.	G	.	.	.	T	.	G	.	A	G	T	.	T	.	1			1
	350	.	.	.	.	.	.	G	.	.	.	T	.	G	.	A	G	T	.	.	.	1			1
	314	G	C	C	C	T	T	.	G	G	.	T	T	G	G	A	G	T	A	T	A	1		1	1
	329	G	C	C	C	T	T	.	G	G	.	T	T	G	G	A	G	T	A	T	A	1			1
	330	G	C	C	C	T	T	.	G	G	.	T	T	G	G	A	G	T	A	T	A	2			2
301 C	331	G	C	C	C	T	T	.	G	G	.	T	T	G	G	A	G	T	A	T	A	1			1
	336	G	C	C	C	T	T	.	G	G	.	T	T	G	G	A	G	T	A	T	A	3			3
	343	G	C	C	C	T	T	.	G	G	.	T	T	G	G	A	G	T	A	T	A	1			1
	345	G	C	C	C	T	T	.	G	G	.	T	T	G	G	A	G	T	A	T	A	1			1
	348	G	C	C	C	T	T	.	G	G	.	T	T	G	G	A	G	T	A	T	A	1			1
	320	.	.	.	.	.	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1			1
	322	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	.	9			4
301 D	332	.	.	.	.	.	T	G	.	.	.	T	.	.	.	.	.	.	A	.	.	7			1
	335	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	.	.	4			3
	337	.	.	.	.	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1			1
	302	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	6	5	6	11
	303	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			1	1
	304	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2		9	6
	305	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	8		21	15
	306	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	6	1	33	23
302	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1		3	1
	311	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	4	5	1	5
	307	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2	2	8	11
	313	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			1	1
	319	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			1	1
1	7	.	.	C	.	T	T	G	.	T	.	T	T	G	T	.	.	A	.	T	.			1	1
2	8	.	.	C	.	T	T	G	.	T	T	T	T	G	T	.	.	A	.	T	.			2	2
4	9	.	.	C	.	T	T	G	.	T	T	T	T	G	T	.	.	A	.	T	.			3	3
5	23	.	.	C	.	T	T	G	.	T	.	T	T	G	T	.	.	A	.	T	.			1	1

*Peptide group #301 is subdivided in 4 parts (A, B, C and D) according to synonymous mutations. **SW = Surface water, DM = Domesticated Mammals, P = Poultry.