Table 2. Twenty variable sites across the 18 haplotypes based on the 293-bp 16S rRNA fragment.

Haplotype		Nucleotide Position																			N
	19	42	71	102	103	106	145	151	155	156	158	197	205	210	217	258	281	282	285	286
A	G	A	T	C	C	C	C	A	T	A	A	T	T	C	A	A	T	T	T	T	1
B	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1
C	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	.	.	.	.	.	.	.	.	-	409
D	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	-	55
E	A	C	.	.	.	.	.	.	.	.	G	.	.	.	.	.	.	.	.	-	3
F	A	.	.	.	.	.	.	.	C	.	G	.	.	.	.	.	.	.	.	-	33
G	A	.	.	.	.	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	-	1
H	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3
I	A	.	.	T	.	.	.	G	.	T	.	C	.	.	.	.	.	.	.	.	11
J	A	.	.	T	.	.	.	G	.	T	.	.	.	.	.	.	.	A	.	-	2
K	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	.	.	-	-	12
L	A	.	.	G	.	.	.	G	.	T	.	C	C	.	.	.	.	.	-	-	10
M	A	.	.	T	.	.	.	G	.	T	.	C	.	.	.	.	.	.	.	-	2
N	A	.	.	T	.	.	.	G	.	T	.	.	.	.	G	.	.	.	.	-	2
O	A	.	.	.	.	.	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	.	.	-	5
P	A	.	.	.	T	.	.	.	.	.	G	.	.	.	.	.	.	.	.	-	8
Q	A	.	C	.	.	.	.	.	.	.	G	.	.	.	.	.	.	.	.	-	1
R	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	.	.	.	.	-	-	1

A dot represents an identical nucleotide with respect to the reference haplotype A. N represents the number of individuals sampled for each haplotype.