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. 2014 Oct 9;9(10):e109872. doi: 10.1371/journal.pone.0109872

Table 1. Average ±SD values from DTI indices (FA, MD, and RD) and normalized volume from gray and white matter regions of the brain between wild type (n = 7) and NL-3 (n = 10) mice at 30 days of age.

# Regions FA MD×10−3 RD Normalize brain volume
WT NL-3 WT NL-3 WT NL-3 WT NL-3
1 Lat ventricle 0.36±0.03 0.32±0.03 0.25±0.02 0.26±0.03 0.21±0.02 0.23±0.03 0.20±0.02 0.19±0.02
2 Hippo CA3 0.26±0.01 0.26±0.01 0.25±0.02 0.25±0.02 0.23±0.02 0.23±0.02 0.20±0.02 0.20±0.01
3 Hippo CA1 0.29±0.02 0.29±0.02 0.26±0.01 0.26±0.01 0.23±0.01 0.23±0.01 0.17±0.01 0.19±0.09
4 Hippo dent gyr 0.26±0.02 0.25±0.01 0.26±0.02 0.27±0.01 0.24±0.02 0.25±0.01 0.18±0.02 0.19±0.01
5 Hippo gen 0.30±0.01 0.30±0.01 0.25±0.02 0.25±0.02 0.22±0.02 0.23±0.02 0.18±0.01 0.18±0.01
6 Olfact system 0.25±0.03 0.26±0.03 0.26±0.02 0.25±0.02 0.25±0.02 0.23±0.02 0.83±0.02 0.91±0.01
7 Frontal cortex 0.24±0.02 0.23±0.02 0.26±0.03 0.25±0.03 0.24±0.02 0.23±0.02 0.44±0.01 0.44±0.03
8 Perirh cortex 0.28±0.03 0.26±0.03 0.26±0.02 0.24±0.02 0.25±0.02 0.23±0.02 0.10±0.01 0.10±0.01
9 Entorhi cortex 0.22±0.02 0.20±0.02 0.27±0.01 0.26±0.01 0.25±0.01 0.24±0.01 0.27±0.01 0.27±0.02
10 Cortex general 0.26±0.03 0.25±0.03 0.26±0.02 0.25±0.02 0.24±0.02 0.23±0.01 0.81±0.02 0.78±0.04
11 Caud putamen 0.22±0.01 0.21±0.02 0.25±0.02 0.24±0.02 0.24±0.02 0.23±0.02 0.46±0.02 0.43±0.02
12 B gang general 0.26±0.02 0.25±0.02 0.23±0.02 0.23±0.02 0.21±0.02 0.22±0.02 0.26±0.01 0.25±0.01
13 Corpus callosum 0.51±0.03 0.50±0.03 0.20±0.03 0.19±0.03 0.16±0.02 0.15±0.02 0.27±0.01 0.25±0.02
14 Ant commissure 050±0.03 0.48±0.04 0.22±0.03 0.21±0.03 0.1 6±0.02 0.16±0.02 0.04±0.03 0.04±0.02
15 Lat olfact tract 0.29±0.04 0.31±0.03 0.26±0.03 0.25±0.02 0.24±0.02 0.22±0.02 0.05±0.06 0.05±0.03
16 Internal capsule 0.53±0.01 0.51±0.02 0.21±0.03 0.20±0.03 0.16±0.02 0.16±0.02 0.11±0.01 0.10±0.01
17 Amygdala 0.22±0.02 0.21±0.02 0.25±0.02 0.26±0.02 0.24±0.02 0.24±0.02 0.32±0.01 0.31±0.02
18 Third ventricle 0.25±0.03 0.24±0.03 0.26±0.02 0.27±0.03 0.24±0.01 0.25±0.03 0.09±0.01 0.09±0.01
19 Thalamus 0.33±0.02 0.32±0.02 0.23±0.03 0.22±0.03 0.21±0.03 0.21±0.03 0.44±0.02 0.44±0.02
20 Hypothalamus 0.26±0.02 0.25±0.04 0.23±0.03 0.21±0.02 0.21±0.03 0.20±0.02 0.20±0.01 0.20±0.01
21 Cereb aqueduct 0.24±0.05 0.25±0.04 0.33±0.10 0.26±0.05 0.31±0.10 0.26±0.05 0.29±0.02 0.31±0.01
22 Substantia nigra 0.38±0.03 0.36±0.02 0.22±0.03 0.22±0.02 0.19±0.02 0.19±0.02 0.07±0.01 0.07±0.01
23 Sup+Inf colli 0.25±0.02 0.25±0.01 0.24±0.02 0.23±0.02 0.23±0.02 0.22±0.02 0.36±0.01 0.36±0.02
24 Periaqued Gray 0.25±0.03 0.25±0.02 0.23±0.04 0.22±0.03 0.21±0.03 0.21±0.03 0.12±0.01 0.13±0.01
25 Midbrain general 0.32±0.02 0.31±0.02 0.23±0.03 0.22±0.02 0.21±0.02 0.20±0.02 0.38±0.01 0.38±0.01
26 Cereb general 0.32±0.03 0.31±0.02 0.22±0.02 0.21±0.02 0.20±0.03 0.19±0.02 0.57±0.02 0.58±0.03
27 Fourth ventricle 0.26±0.03 0.25±0.03 0.37±0.05 0.36±0.07 0.35±0.05 0.34±0.08 0.11±0.01 0.11±0.01
28 Pons 0.35±0.03 0.34±0.02 0.27±0.02 0.25±0.02 0.24±0.02 0.22±0.02 0.62±0.02 0.66±0.03
29 Medulla 0.30±0.02 0.30±0.02 0.26±0.03 0.25±0.02 0.24±0.02 0.23±0.02 0.60±0.09 0.65±0.09
30 Optic nerve 0.45±0.06 0.43±0.05 0.27±0.02 0.25±0.02 0.21±0.02 0.21±0.02 0.57±0.03 0.56±0.05
31 Fornix system 0.49±0.05 0.49±0.03 0.22±0.03 0.22±0.02 0.17±0.03 0.16±0.02 0.12±0.01 0.12±0.01
32 Pituitary 0.34±0.09 0.32±0.07 0.41±0.07 0.35±0.09 0.37±0.08 0.33±0.10 0.03±0.01 0.03±0.01
33 Septum 0.29±0.03 0.26±0.03 0.23±0.03 0.23±0.03 0.21±0.02 0.21±0.02 0.08±0.01 0.08±0.01
34 Motor cortex 0.23±0.02 0.23±0.02 0.26±0.03 0.26±0.03 0.25±0.02 0.24±0.03 0.30±0.01 0.30±0.02
35 Somatosen cortex 0.23±0.02 0.22±0.02 0.26±0.02 0.25±0.02 0.25±0.02 0.24±0.02 0.75±0.02 0.71±0.02
36 Auditory cortex 0.25±0.02 0.24±0.02 0.26±0.02 0.25±0.02 0.24±0.02 0.23±0.02 0.13±0.01 0.13±0.01
37 Visual cortex 0.22±0.02 0.21±0.02 0.27±0.02 0.26±0.02 0.25±0.02 0.25±0.02 0.37±0.02 0.36±0.02
38 Cerebellar cortex 0.29±0.04 0.28±0.02 0.24±0.02 0.23±0.01 0.22±0.03 0.21±0.02 0.82±0.04 0.85±0.05
39 Cereb peduncle 0.52±0.03 0.51±0.04 0.27±0.02 0.26±0.02 0.21±0.02 0.21±0.02 0.45±0.01 0.41±0.02

FA  = fractional anisotropy, MD  = mean diffusivity, RD  = radial diffusivity, WT  = wild type. [Lat ventricle  = lateral ventricle; Hippo CA3  =  hippocampus CA3, Hippo CA1  = hippocampus CA1, Hippo dent gyr  = hippocampus dentate gyrus, Hippo gen  = hippocampus general, Olfact system  = olfactory system, Perirh cortex  = perirhinal cortex, Entorhi cortex  =  entorhinal cortex, Caud putamen  = caudate putamen, B gang general  =  basal ganglia general, Ant commissure  = anterior commissure, Lat olfact tract  = lateral olfactory tract, Cereb aqueduct  = cerebral aqueduct, Sup+Inf colli  =  superior and inferior collicus, Periaqued gray  =  periaqueductal gray matter, Cereb general  = cerebellum general, Somatosen cortex  = somatosensory cortex, Cereb peduncle  = cerebral peduncle].