Table 1.
Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) results in comparison with conventional methods and sequencing.
| Strains | ID CM a | ID Sequencing | ID MALDI-TOF MS | |||
|---|---|---|---|---|---|---|
| Before Suppl. b | Score | After Suppl. b | Score | |||
| Supplemented reference strains (13) | ||||||
| T. tonsurans 0865 | T. tonsurans | T. tonsurans | 2.01 | T. tonsurans | 2.42 | |
| T. rubrum 1515 | T. rubrum | T. rubrum | T. rubrum | 2 | T. rubrum | 2.35 |
| T. rubrum 0544 | T. rubrum | T. rubrum | 2.03 | T. rubrum | 2.41 | |
| T. interdigitale 1681 | T. interdigitale | T. ment./T. int. c | T. tonsurans | 2.22 | T. interdigitale | 2.42 |
| T. interdigitale 1208 | T. interdigitale | T. ment./T. int. c | T. tonsurans | 2.14 | T. interdigitale | 2.34 |
| T. interdigitale 0389 | T. interdigitale | T. tonsurans | 2.05 | T. interdigitale | 2.3 | |
| T. mentagrophytes 0866 | T. mentagrophytes | T. ment./T. int. c | T. tonsurans | 2.09 | T. mentagrophytes | 2.48 |
| T. erinacei 0388 | T. erinacei | NR | <1.5 | T. erinacei | 2.27 | |
| M. canis 0164 | M. canis | M. canis | M. canis | 2.25 | M. canis | 2.31 |
| M. persicolor 0165 | M. persicolor | NR | <1.3 | M. persicolor | 2.29 | |
| M. gypseum 7177 | M. gypseum | M. gypseum | 2.13 | M. gypseum | 2.27 | |
| M. fulvum 9834 | M. fulvum | NR | <1.6 | M. fulvum | 2.18 | |
| E. floccosum 1207 | E. floccosum | E. floccosum | 2.12 | E. floccosum | 2.35 | |
| Supplemented clinical isolates (11) | ||||||
| T. tonsurans PR1 | T. tonsurans | T. tonsurans | T. tonsurans | 2.12 | T. tonsurans | 2.34 |
| T. rubrum PR1 | T. rubrum | T. rubrum | T. rubrum | 2.01 | T. rubrum | 2.12 |
| T. interdigitale PR1 | T. interdigitale | T. ment./T. int. c | T. tonsurans | 2.09 | T. ment./T. int. c | 2.19 |
| T. interdigitale PR2 | T. interdigitale | T. ment./T. int. c | T. tonsurans | 2.14 | T. ment./T. int. c | 2.36 |
| T. mentagrophytes PR1 | T. mentagrophytes | T. ment./T. int. c | T. tonsurans | 2.14 | T. ment./T. int. c | 2.19 |
| T. mentagrophytes PR2 | T. mentagrophytes | T. ment./T. int. c | T. tonsurans | 2.18 | T. ment./T. int. c | 2.25 |
| M. canis PR1 | M. canis | M. canis | M. canis | 1.95 | M. canis | 2.45 |
| M. canis PR2 | M. canis | M. canis | M. canis | 2.05 | M. canis | 2.34 |
| T. violaceum PR1 | T. violaceum | T. violaceum | NR | <1.5 | T. violaceum | 2.22 |
| T. soudanense PR1 | T. soudanense | T. soudanense | NR | <1.3 | T. soudanense | 2.15 |
| M. audouinii PR1 | M. audouinii | M. audouinii | NR | <1.6 | M. audouinii | 2.21 |
| Identified clinical isolates (64) | ||||||
| EFPR 1, 2, 3 | E. floccosum | E. floccosum | >2 | E. floccosum | >2 | |
| MCPR 3, 4, 5, 9 | M. canis | >2 | M. canis | >2 | ||
| MCPR 6, 7 | M. canis | M. canis | 1.7–2 | M. canis | >2 | |
| MCPR 8 | NR | <1.7 | M. canis | >2 | ||
| MAPR 2 | M. audouinii | M. canis | 1.7–2 | M. audouinii | 1.7–2 | |
| TVPR 2, 3 | T. violaceum | NR | <1.5 | T. violaceum | 1.7–2 | |
| TTPR 3 | T. tonsurans | T. tonsurans | >2 | T. tonsurans | >2 | |
| TTPR 4 | T. tonsurans | 1.7–2 | T. tonsurans | >2 | ||
| TTPR 2 | T. rubrum | 1.7–2 | T. tonsurans | 1.7–2 | ||
| TRPR 9, 16, 19, 21, 22, 23 | T. rubrum | T. rubrum | >2 | T. rubrum | >2 | |
| TRPR 2, 3, 5, 12, 14, 15, 24 | T. rubrum | 1.7–2 | T. rubrum | 1.7–2 | ||
| TRPR 4, 10, 11, 17, 18, 20, 23 | T. rubrum | 1.7–2 | T. rubrum | >2 | ||
| TRPR 6, 8 | T. tonsurans | 1.7–2 | T. rubrum | 1.7–2 | ||
| TRPR 7 | NR | <1.7 | T. rubrum | 1.7–2 | ||
| TMPR 3, 4, 5, 9, 11, 12, 14, 15, 16, 17, 18 | T. mentagrophytes | T. tonsurans | >2 | T. ment./T. int. c | >2 | |
| TMPR 6, 19 | T. tonsurans | >2 | T. ment./T. int. c | 1.7–2 | ||
| TMPR 7 | M. gypseum | 2 | T. ment./T. int. c | >2 | ||
| TMPR 8, 13, 20, 21 | T. tonsurans | 1.7–2 | T. ment./T. int. c | >2 | ||
| TMPR 10 | NR | <1.5 | T. ment./T. int. c | >2 | ||
| TIPR 3, 4 | T. interdigitale | T. tonsurans | >2 | T. ment./T. int. c | >2 | |
| TSPR 2 | T. soudanense | T. rubrum | 1.7–2 | T. soudanense | 1.7–2 | |
| TSPR 3 | NR | <1.5 | T. soudanense | >2 | ||
| MGPR 1 | M. gypseum | M. gypseum | >2 | M. gypseum | >2 | |
| MPPR 1 | M. persicolor | NR | <1.6 | M. persicolor | >2 | |
a ID CM = identification by conventional methods; b Suppl. = supplementation; c T. ment./T. int. = T. mentagrophytes/T. interdigitale; NR = no reliable identification.