TABLE 2.
Detection of LOH in strains of C. albicans
Marker no.a | Marker nameb | Flanking gene | Chromosome | Genotype of strainc
|
||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CAI4 | RM1000 | BWP17 | AF14 | AF27 | ||||
76 | 2195/2207d | URA3 | 3P | Het | Het | Het | Het | Het |
118 | 1341/2493e | HIS1 | 5I | Het | Het | Het | Het | Het |
120 | 2340/2493e | HIS1 | 5I | Het | Hom | Hom | Het | Hom |
141 | 1883/2139f | ARG4 | 7G | Het | Het | Het | Het | Het |
143 | 1530/2473 (1 to 3)f | ARG4 | 7G | Het | Het | Het | Het | Het |
22 | 1322/2294 | NA | 1S | Het | Het | Het | Hom | Het |
23 | 1799/2450 | NA | IS | Het | Het | Het | Hom | Het |
24 | MNS1 | NA | 1S | Het | Het | Het | Hom | Het |
25 | 2036/2375 | NA | 1S | Het | Het | Het | Hom | Het |
26 | 2281/2302 | NA | 1S | Het | Het | Het | Hom | Het |
27 | 2032/2371 | NA | 1S | Het | Het | Het | Hom | Het |
28 | 1449/2362 | NA | 1S | Het | Het | Het | Hom | Het |
29 | 1363/2056g | GAL1 | 1S | Het | Het | Het | Hom | Het |
30 | 1622/2428g | GAL1 | 1E | Het | Het | Het | Het | Het |
42 | 2106/2441 | NA | 1L | Het | Hom | Het | Het | Hom |
43 | 1729/2211 | NA | 1L | Het | Hom | Het | Het | Hom |
46 | 1584/2265 | NA | 1 | Het | Het | Het | Hom | Het |
48 | 1353/2363 | NA | 2U | Het | Hom | Hom | Het | Hom |
103 | 1718/2417 (HST3) | NA | 5M | Het | Het | Het | Hom | Hom |
113 | 1969/2162 | NA | 5M | Het | Het | Het | Het | Hom |
137 | 2397/2498 | NA | 7F | Hom | Hom | Hom | Hom | Hom |
147 | 2080/2297 (DLH1) | NA | Het | Hom | Hom | Het | Hom |
Numbering corresponds to the supplemental material and Fig. 2.
The names of markers correspond either to the two contig-6 sequence numbers from which they were generated or to the corresponding gene.
Het, heterozygous; hom, homozygous; NA, not applicable.
URA3 is at the end of contig-19-10123 (see Fig. 2); only SNP marker 2195/2207 was available for sequencing.
Flanks HIS1.
Flanks ARG4.
Flanks GAL1.