. 2014 Oct 20;9(10):e109290. doi: 10.1371/journal.pone.0109290

Table 3. The top 20 interaction terms after case-control studies in RS-I, RS-II and RS-III separate and combined.

Interaction	Case-control in RS-I			Case-control in RS-II			Case-control in RS-III			Case-control RS combined
	β_int	SE	p-value	β_int	SE	p-value	β_int	SE	p-value	β_int	SE	p-value
rs6442460–rs10914332	−0,5227	0,286	0,0673	−0,4306	0,396	0,2775	−0,6454	0,305	0,0346	−0,53	0,1841	0,00398
rs2146043–rs11124513	−0,25056	0,172	0,1452	−0,2557	0,249	0,3039	−0,356	0,179	0,0472	−0,302	0,1097	0,00591
rs774801–rs12442098 *1	0,35367	0,18	0,0497	0,4151	0,245	0,0898	0,1702	0,21	0,4188	0,293	0,1175	0,01267
rs3006496–rs17729021	0,25625	0,135	0,0579	0,198	0,186	0,2872	0,1344	0,147	0,359	0,208	0,087	0,01694
rs754970–rs2306478 *2	−0,17851	0,153	0,2422	−0,17	0,181	0,3469	−0,2445	0,137	0,0741	−0,202	0,0871	0,0205
rs754970–rs3775972 *2	−0,17089	0,152	0,2614	−0,1678	0,18	0,3501	−0,2482	0,137	0,0695	−0,199	0,0869	0,02226
rs5770418–rs17234336	−0,94012	0,422	0,0258	−0,6081	0,53	0,2513	−0,2122	0,318	0,5047	−0,489	0,2213	0,02703
rs7631734–rs12442098 *1	0,31044	0,181	0,0855	0,4119	0,247	0,0959	0,1156	0,211	0,5845	0,256	0,1179	0,03002
rs2242312–rs11190870	0,24296	0,226	0,2833	0,4927	0,323	0,1275	0,2608	0,231	0,2594	0,304	0,1437	0,03462
rs4861849–rs17123865	−0,04394	0,415	0,9156	0,8862	0,499	0,0757	0,7524	0,338	0,0262	0,446	0,2265	0,04902
rs754950–rs4658547 *3	−0,15255	0,162	0,3451	−0,2093	0,232	0,367	−0,2082	0,174	0,2314	−0,202	0,1045	0,05368
rs1203791–rs10496556	−0,29897	0,151	0,0479	−0,0571	0,189	0,7629	−0,1164	0,155	0,4514	−0,162	0,0923	0,07865
rs754950–rs10926977 *3	−0,15562	0,159	0,3275	−0,1923	0,229	0,4002	−0,1322	0,17	0,4372	−0,172	0,1026	0,09409
rs900654–rs10195135 *4	0,07114	0,161	0,6594	0,3194	0,209	0,1267	0,2456	0,17	0,1477	0,168	0,1006	0,09566
rs10195135–rs10872670 *4	0,1016	0,16	0,5246	0,2728	0,21	0,1947	0,2195	0,168	0,192	0,166	0,1003	0,09804
rs2919732–rs12759209	−0,18926	0,171	0,2683	−0,3477	0,217	0,1086	−0,0725	0,164	0,6583	−0,168	0,1022	0,10006
rs806454–rs17578868	0,22532	0,17	0,1861	0,3827	0,26	0,1404	0,093	0,177	0,5992	0,18	0,1102	0,10155
rs2013041–rs10511302	0,00345	0,143	0,9808	−0,1725	0,19	0,363	−0,305	0,157	0,0518	−0,148	0,0911	0,105
rs10494757–rs11520658	−1,77249	1,013	0,08	0,2238	0,687	0,7447	−0,536	0,564	0,3416	−0,608	0,3834	0,11292
rs1426588–rs10248926	0,1073	0,141	0,4472	0,0694	0,195	0,7214	0,2176	0,145	0,1332	0,133	0,0889	0,13558
rs2013041–rs10511302	0,00345	0,143	0,9808	−0,1725	0,19	0,363	−0,305	0,157	0,0518	−0,148	0,0911	0,105
rs10494757–rs11520658	−1,77249	1,013	0,08	0,2238	0,687	0,7447	−0,536	0,564	0,3416	−0,608	0,3834	0,11292
rs1426588–rs10248926	0,1073	0,141	0,4472	0,0694	0,195	0,7214	0,2176	0,145	0,1332	0,133	0,0889	0,13558

The interactions are sorted based on the p-value of the β_int after the case-control study in the combined data set of RS-I, RS-II and RS-III. The HDL levels are adjusted for sex and age, the residuals are not scaled around zero. Number of cases: 416 (RS-I), 244 (RS-II) and 447 (RS-III). Number of controls: 2996 (RS-I), 1602 (RS-II) and 1621 (RS-III). *1–*4 mark the interaction terms that are in high LD with each other: R ²>0.913.