Table IV.
Hydrogen bonding shorter than 2.5 Å (before ‘/’) and 3.0 Å (after ‘/’) count matrix for each position for oligoalanine. The larger numbers in the matrix indicating frequent hydrogen bonds between residues are highlighted by boxes.
acptr/ donor |
1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 0/ 6 |
1719/ 5025 |
0/ 2 |
59/ 80 |
0/ 0 |
0/ 0 |
0/ 0 |
1/ 7 |
0/ 0 |
0/ 0 |
0/ 0 |
0/ 0 |
0/ 0 |
2 | 59/ 392 |
0/ 4 |
1846/ 5361 |
0/ 4 |
0/ 0 |
0/ 0 |
0/ 0 |
0/ 0 |
0/ 0 |
0/ 0 |
0/ 0 |
0/ 0 |
0/ 0 |
3 | 84/ 487 |
232/ 770 |
0/ 4 |
2005/ 5140 |
0/ 1 |
0/ 5 |
0/ 0 |
0/ 0 |
0/ 0 |
0/ 0 |
0/ 0 |
0/ 0 |
0/ 0 |
4 | 852/ 942 |
57/ 593 |
35/ 346 |
0/ 11 |
1340/ 3749 |
0/ 2 |
0/ 3 |
0/ 0 |
636/ 734 |
6/ 40 |
0/ 0 |
0/ 0 |
0/ 0 |
5 | 0/ 0 |
1315/ 1562 |
208/ 1115 |
69/ 356 |
0/ 9 |
1877/ 4512 |
1/ 3 |
0/ 0 |
0/ 1 |
0/ 0 |
0/ 0 |
0/ 0 |
0/ 0 |
6 | 0/ 0 |
0/ 0 |
1756/ 2129 |
257/ 1433 |
33/ 370 |
0/ 5 |
1206/ 3804 |
0/ 0 |
0/ 0 |
0/ 0 |
0/ 0 |
0/ 0 |
0/ 0 |
7 | 280/ 437 |
0/ 0 |
1/ 1 |
2038/ 2517 |
386/ 1969 |
112/ 586 |
0/ 3 |
1194/ 3124 |
0/ 0 |
0/ 0 |
0/ 0 |
142/ 144 |
0/ 0 |
8 | 500/ 552 |
0/ 0 |
0/ 0 |
28/ 81 |
2579/ 3293 |
590/ 2465 |
43/ 357 |
0/ 9 |
1922/ 5468 |
0/ 0 |
0/ 0 |
0/ 0 |
0/ 0 |
9 | 58/ 111 |
0/ 0 |
0/ 0 |
0/ 1 |
2/ 29 |
2786/ 3536 |
467/ 2279 |
103/ 438 |
0/ 2 |
1538/ 4963 |
0/ 0 |
0/ 0 |
5/ 15 |
10 | 0/ 0 |
0/ 0 |
44/ 48 |
0/ 0 |
0/ 0 |
1/ 10 |
2191/ 3011 |
442/ 1818 |
99/ 762 |
0/ 3 |
1841/ 5120 |
0/ 0 |
0/ 0 |
11 | 0/ 0 |
0/ 0 |
0/ 0 |
0/ 0 |
0/ 0 |
0/ 0 |
0/ 2 |
1264/ 1687 |
207/ 1005 |
131/ 698 |
0/ 4 |
1933/ 5847 |
0/ 2 |
12 | 0/ 0 |
0/ 0 |
0/ 0 |
0/ 0 |
0/ 0 |
0/ 0 |
0/ 0 |
0/ 0 |
653/ 830 |
185/ 596 |
113/ 501 |
0/ 4 |
1964/ 6018 |
13 | 0/ 0 |
0/ 0 |
0/ 0 |
0/ 1 |
0/ 0 |
0/ 0 |
0/ 0 |
7/ 25 |
40/ 70 |
503/ 747 |
96/ 446 |
62/ 417 |
0/ 2 |