Table 3. Amino acid differences between East Coast and WN02 genotype isolates.

	C			E							NS1		NS2A						NS2B			NS3			NS4B	NS5
virus	104	119	121	51	89	123	159	253	332	396	236	308	26	52	89	90	95	188	99	119	121	162	188	334	14	49	314	647	860
NY99	K	A	V	A	A	T	V	I	T	H	I	I	K	T	F	M	L	R	M	V	V	I	Q	S	S	V	K	K	A
2	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	.	.	.	.	.	V	.	.	.	.	.	.	K	.	.	.	.	.	.
3	.	.	.	.	.	.	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
4	.	.	.	.	.	.	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	.	.	M	.	.	.	.	.	.	T
5	.	V	A	T	.	.	A	.	M	.	.	.	R	.	L	.	.	.	.	L	.	.	.	.	.	.	R	.	.
6	R	.	.	.	.	.	A	.	.	.	V	.	.	.	.	.	.	K	.	.	I	.	.	.	.	I	.	.	.
7	.	.	.	.	.	.	A	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	.
8	.	S	.	.	V	N	A	.	.	.	.	V	.	I	.	.	F	.	.	.	.	.	.	T	I	.	.	.	.