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. 2014 May 22;25(12):2764–2777. doi: 10.1681/ASN.2012080823

Table 1.

Candidate podocyte genes identified by a genome-wide search of the Lmx1b-FoxC motif in human and mouse genomes

Gene Human Mouse Description
Motif Sequence Position Motif Sequence Position
ABHD1 TAATTAccctaATAAACA −6418 TATTTATttaatTAATTA −5998 Abhydrolase domain containing 1
ANKRD6 TATTTGTgataacaTAATTA −2998 TAATTAcatgcagATAAACA −7198 Ankyrin repeat domain 6
ATP5H TAATTAcagtgACAAACA −1978 TGTTTGTtttgtttTTATTAA −3178 ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial Fo complex, subunit d
CASQ2 TAATTAtttagaaATAAACA −9778 TAATTAttttaATAAATA −8518 Calsequestrin 2 (cardiac muscle)
CCNC TATTTAGaaaaaTAATTA −1438 TGTTTATgtaagTAATTA −4258 Cyclin C
COL6A3 TAATTAtaaaaCCAAACA −7018 TAATTAaaaaaCCAAATA −7798 Collagen, type VI, alpha 3
CYB5R4 TATTTGTatataaaTTATTAA −2218 TATTTGTatatacaTTATTAA −2158 Cytochrome b5 reductase 4
DCAF15 TATTTATtaaatTAATTA −8398 TATTTATtaccaTTATTAA −838 DDB1 and CUL4 associated factor 15
DUT TGTTTGGtttaataTAATTA −6238 TAATTAtctggATAAACA −5398 Deoxyuridine triphosphatase
EREG TTAATAAtttacACAAATA −6418 TGTTTAGtatgaaaTAATTA −4798 Epiregulin
FOXA2 TATTTAGctcatcaTTATTAA −8098 TAATTAttataATAAATA −8158 Forkhead box A2
GABRP TATTTATaatcaTTATTAA −9418 TTAATAAtaataATAAATA −2398 γ-aminobutyric acid (GABA) A receptor, pi
GATA6 TTAATAAtgataATAAATA −4798 TTAATAAtgactCTAAATA −5038 GATA binding protein 6
KIF2B TATTTAGgagatagTTATTAA −5218 TATTTAGaagacaaTTATTAA −6298 Kinesin family member 2B
LMBRD2 TATTTATtttctTAATTA −3298 TAATTAgaatttgATAAATA −8758 LMBR1 domain containing 2
MEIS2 TATTTATccctcTAATTA −8938 TATTTATccctcTAATTA −9598 Meis homeobox 2
MIR128-1 TAATTAttcaaCCAAATA −1018 TAATTAttcagCCAAATA −1318 MicroRNA 128-1
NPHS2 TTAATAAagaccCTAAATA −778 TATTTGTtgtctggTAATTA −4138 Nephrosis 2, idiopathic, steroid-resistant (podocin)
POGZ TGTTTAGctgagccTAATTA −2338 TGTTTGTgaagcTAATTA −358 Pogo transposable element with ZNF domain
RAB14 TAATTAcaaagATAAATA −6778 TGTTTAGttttactTAATTA −5638 Rab14, member RAS oncogene family
SLC16A9 TGTTTAGtatttTAATTA −7138 TTAATAAacaggggATAAACA −2998 Solute carrier family 16, member 9
SOHLH2 TGTTTAGtgaaattTAATTA −9598 TATTTATaaatataTAATTA −2038 Spermatogenesis and oogenesis specific basic helix-loop-helix 2
SRPX2 TATTTGTtgaatTAATTA −1318 TATTTGTtgaatTAATTA −2278 Sushi-repeat containing protein, X-linked 2
STMN4 TGTTTATtttgaaaTAATTA −6958 TATTTATttattgtTAATTA −4078 Stathmin-like 4
TSPAN6 TAATTAattcaACAAATA −2938 TAATTAattcaACAAATA −7798 Tetraspanin 6
VPS37B TATTTGTgatcgccTAATTA −298 TAATTAaataacaATAAATA −6718 Vacuolar protein sorting 37 homolog B (S. cerevisiae)
ZSCAN30 TGTTTAGagcagctTTATTAA −8458 TAATTAagaaaATAAATA −1738 Zinc finger and SCAN domain containing 30