. Author manuscript; available in PMC: 2014 Nov 25.

Published in final edited form as: Yeast. 2010 Aug 24;27(12):1039–1048. doi: 10.1002/yea.1813

Table 3.

Primers used in this study

Primer name	Sequence 5′ → 3′
Plasmid construction
TEF2pt-5’	GTGGGTACCGACGTCGTATAGTGCTTGCTGTTCGATATT
TEF2pt-3’	GGTGGTGGTCTCGAGGATTGATTATATAAAATGTATACTTAGAAAA
ACT1pt-5’	GGTGGTTCTAGAAGAGCTATTAAGATCACCAGCCT
ACT1pt-3’	GGTGGTTTAATTAATTTGAATGATTATATTTTTTTAATATTAA
ACT1tm-5’	GGTGGTGGATCCGAGTGAAATTCTGGAAATCTGGA
ACT1tm-3’	GGTTCTAGAGACGTCATTTTATGATGGAATGAATGGGA
Gene deletion
Upstream primers
ARG4 5’	ATTTTGAAACAATGAATCGATGCTT
ARG4 3’	TCGCCCTATAGTGAGTCGTTATTAATTGATTATCTTGATAGCTGTTATG
HIS1 5’	GTGCCACTGTATACGCATTT
HIS1 3’	TCGCCCTATAGTGAGTCGTTATCGGTAGTTGGTGGTTAAGTAA
LEU2 5’	TTAGTTTCTATTATGGCCGTCAAT
LEU2 3’	TCGCCCTATAGTGAGTCGTGTTTTTTGGATATTGGTTTTAAAAGA
Downstream primers
ARG4 5’	TTCCCTTTAGTGAGGGTTAATTTATAAATAGTCATATAATAATCACAGTAT
ARG4 3’	TGCAAACAAACAGGGGAAAA
HIS1 5’	TTCCCTTTAGTGAGGGTTAAAAGAAGTGATAGTTTCTCATAAATAT
HIS1 3’	TCAATTATGTTGATTAGCTACAGTCA
LEU2 5’	TTCCCTTTAGTGAGGGTTAAACAGTATATACAGTAGTTAGCATTT
LEU2 3’	TTTATACCACGTGGTGACGAA
Fusion primers
ARG4 5’	CATAACAGCTATCAAGAATAATCAATTAATAACGACTCACTATAGGGCGA
ARG4 3’	ATACTGTGATTATTATATGACTATTTATAAAATAACCCTCACTAAAGGGAA
HIS1 5’	TTACTTAACCACCAACTACCGATAACGACTCACTATAGGGCG
HIS1 3’	ATATTTATGAGAAACTATCACTTCTTTTAACCCTCACTAAAGGGAA
LEU2 5’	TCTTTTAAAACCAATATCCAAAAAACACGACTCACTATAGGGCGA
LEU2 3’	AAATGCTAACTACTGTATATACTGTTTAACCCTCACTAAAGGGAA
HygB 5’	CTGGAATTGGCAAAGCAGCAGAAGCA
HygB 3’	TCAGCTGCTGTTTGGACTGATGGTTGT
Nours 5’	GTTCTCAGCATCCAATGTTTCCGCCA
Nours 3’	CTTCAAGTCTCGAACGAAACAGCGAT
Verification Primers
ARG4 5’	GGTTCCTGGATTTGCGCAGCCTTATA
ARG4 3’	CGCGATTAGAACTTGTGGACCTATCCT
ARG4 3’A	CGTGTGATGTCAGTTGTTCAAGGTTGACT
ARG4 3’B	GCAGTTCCAAAGATTGAAGCGTCTTCGT
ARG4 3’C	GCTACATTACCCTCTGTTGCCACAAGCAT
ARG4 3’D	GTCTTTGGATCGGTAGTACTGTGGCA
HIS1 5’	AGGAAGGTCACAGCTTGGGGTTTGAT
HIS1 3’	GATTGGGTGGCCATATTGTTCAAGGACA
LEU2 5’	TGCCAGACATATGCAAGATGAAGGGT
LEU2 3’	ACCCACCATTACGCAGAAGAAAGTCA