Table IV.

Gene-level P values with number of SNPs for 9p21 genes in eight cancers^a

Gene	Starting	Ending	ESCC		GC		PanC		RCC		LC		BrC		BC		PrC
			No.	P	No.	P	No.	P	No.	P	No.	P	No.	P	No.	P	No.	P
IFNB1	21067104	21087943	4	0.66	4	0.80	4	0.79	4	0.02	4	0.30	5	0.14	7	0.12	5	0.63
IFNW1	21120631	21152144	7	0.15	7	0.28	8	0.72	8	0.36	8	0.68	8	0.23	10	0.14	8	0.54
IFNA21	21145636	21176659	3	0.95	3	0.81	3	0.31	4	0.98	3	0.23	3	0.55	8	0.82	3	0.24
IFNA4	21166693	21197670	5	0.95	5	0.52	5	0.09	7	0.92	4	0.48	5	0.90	8	0.50	5	0.36
IFNA7	21181468	21212204	4	0.94	4	0.50	4	0.09	5	0.91	3	0.47	4	0.90	7	0.57	4	0.36
IFNA10	21186180	21217142	3	0.93	3	0.49	3	0.08	4	0.90	3	0.47	4	0.90	7	0.57	4	0.36
IFNA16	21196372	21227310	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	1	0.74	4	0.84	1	0.75
IFNA17	21207242	21238221	1	0.44	1	0.85	1	0.14	2	0.69	1	0.44	1	0.97	4	0.41	1	0.74
IFNA14	21219201	21249978	3	0.64	2	0.82	3	0.26	4	0.86	3	0.58	3	0.24	5	0.45	3	0.27
IFNA5	21284686	21315255	7	0.91	7	0.56	7	0.04	9	0.95	6	0.89	6	0.98	10	0.97	7	0.75
KLHL9	21311018	21345429	6	0.83	6	0.24	6	0.02	6	0.21	6	0.27	6	0.52	10	0.62	6	0.82
IFNA6	21330317	21360886	3	0.54	3	0.22	3	0.01	4	0.14	3	0.15	3	0.31	11	0.89	3	0.58
IFNA13	21347423	21378075	3	0.08	3	0.05	3	0.03	4	0.78	3	0.79	3	0.42	12	0.92	3	0.80
IFNA2	21364254	21395396	6	0.13	6	0.09	6	0.04	6	0.86	6	0.89	6	0.57	12	0.80	6	0.93
IFNA8	21379146	21410184	6	0.54	6	0.23	9	0.24	9	0.27	9	0.88	8	0.56	14	0.89	9	0.60
IFNA1	21410440	21441315	4	0.56	4	0.21	5	0.71	5	0.10	4	0.53	5	0.82	6	0.29	5	0.51
IFNE1	21460839	21492312	7	0.75	7	0.008	7	0.24	6	0.006	4	0.18	5	0.33	10	0.96	6	0.45
MTAP	21772635	21865969	16	0.04	16	0.81	20	0.62	19	0.17	19	0.08	21	0.22	42	0.02	20	0.94
CDKN2A	21947751	22004490	15	2.70×10 −5b	15	0.06	16	0.56	15	0.88	15	0.09	15	0.52	23	0.11	15	0.52
CDKN2B-AS1	21964790	22121093	31	4.70×10 −5b	31	0.22	32	0.43	31	0.70	30	0.13	30	0.92	46	0.16	31	0.35
CDKN2B	21982902	22019312	10	1.80×10 −5b	10	0.36	11	0.40	10	0.88	10	0.05	10	0.91	15	0.07	10	0.36
DMRTA1	22416840	22452472	10	0.47	10	0.28	10	0.32	10	0.70	10	0.19	10	0.24	15	0.42	10	1.00
ELAVL2	23670103	23836063	51	0.07	51	0.39	53	0.03	52	0.94	51	0.84	49	0.92	67	0.99	50	0.94
TUSC1	25656387	25688856	5	0.77	5	0.13	6	0.85	6	0.98	6	0.64	6	0.80	8	0.14	6	0.40
C9orf82	26820683	26902725	8	0.64	8	0.52	6	0.88	9	0.86	9	0.73	9	0.39	20	0.34	9	0.32
PLAA	26884518	26957139	6	0.77	6	0.17	10	0.50	10	0.74	9	0.99	10	0.79	23	0.37	10	0.17
IFT74	26926371	27062931	10	0.41	10	0.41	14	0.54	17	0.83	17	0.71	17	0.81	32	0.57	19	0.31
LRRC19	26973586	27015670	1	0.39	1	0.16	2	0.39	2	0.31	2	0.42	2	0.38	7	0.43	3	0.11
TEK	27079147	27230172	72	0.51	72	0.28	84	0.26	86	0.76	84	0.48	83	0.17	110	0.69	84	0.46
C9orf11	27264667	27307137	19	0.79	19	0.96	22	0.46	21	0.54	20	0.15	21	0.24	31	0.77	21	0.45
MOB3B	27305207	27539850	63	0.87	63	0.36	73	0.01	73	0.10	69	0.18	69	0.41	105	0.26	69	0.60
IFNK	27494312	27526496	8	0.97	8	0.90	8	0.75	8	0.55	8	0.40	8	0.66	14	0.97	8	0.16
C9orf72	27526544	27583476	20	0.60	20	0.52	19	0.81	19	0.71	18	0.41	17	0.89	28	0.98	18	0.10
LINGO2	27928528	28729303	239	0.74	240	0.19	269	0.05	274	0.31	258	0.87	261	0.10	344	0.49	263	0.29
ACO1	32354601	32440834	19	0.02	19	0.05	24	0.68	24	0.46	23	0.50	24	0.88	35	0.21	25	0.03

^aGenes were ordered by the chromosome location and those with P < 0.01 were marked in bold.

^bSignificant after multiple comparison adjustment [P < 0.05/(35 genes × 8 studies)] = 1.79×10⁻⁴.