Methylation-specific PCR (MSP) |
M-MSP |
TAG TCG ATT GAA AGT TCG GGC |
CCT TTC TCG TAA ATC ATT ACG |
|
U-MSP |
TTT TAG TTG ATT GAA AGT TTG GGT |
TTT CCC TTT CTC ATA AAT CAT TAC A |
|
Quantitative Bisulfite Pyrosequencing |
|
GGT TTT TTG TAA GGA GAG AGT AGA GAT |
AAT ATT TTC CCC TTT CCC TTT CT |
ATA TTT TTG TTA TTT AGT TGT AAG A |
Real-time PCR |
LT-β |
GGT TTC AGA AGC TGC CAG AG |
TTC AGC GGA GCG CCT AT |
|
GAPDH |
ACC ACA GTC CAT GCC ATC ACT |
TCC ACC ACC CTG TTG CTG TA |
|
Luciferase Reporter Plasmid |
LT-β
Wild-type
|
CGA GCT CGG GGA ATA TGA GTG CGT GGT G |
GCT CTA GAG CTC TAG ATT TAT CGG CAG CAC TGA AGC |
|
LT-β
Deletion
|
CCC ATG GCA GTG GGA AAA AGA CTG TTT GGA AAT TG |
CAA TTT CCA AAC AGT CTT TTT CCC ACT GCC ATG GG |
|