Table 3.

Thermal cycle programs used for amplification.

Gene	Profile type	Initial denaturing	Cycles	Denaturing	Annealing	Elongation	Final elongation	Rest period
General ITS, BenA, CaM	standard	94 °C, 5 min	35	94 °C, 45 s	55 °C, 45 s	72 °C, 60 s	72 °C, 7 min	10 °C, ∞
General alternative	standard	94 °C, 5 min	35	94 °C, 45 s	52 °C, 45 s	72 °C, 60 s	72 °C, 7 min	10 °C, ∞
RPB2	touch-up	94 °C, 5 min	5	94 °C, 45 s	50 °C, 45 s	72 °C, 60 s
			5	94 °C, 45 s	52 °C, 45 s	72 °C, 60 s
			30	94 °C, 45 s	55 °C, 45 s	72 °C, 60 s	72 °C, 7 min	10 °C, ∞
RPB2 alt.	touch-up	94 °C, 5 min	5	94 °C, 45 s	48 °C, 45 s	72 °C, 60 s
			5	94 °C, 45 s	50 °C, 45 s	72 °C, 60 s
			30	94 °C, 45 s	52 °C, 45 s	72 °C, 60 s	72 °C, 7 min	10 °C, ∞