Table 1. PCR primers used for PCR, quantitative RT-PCR, and dsRNA synthesis.

Genes	Forward	Reverse
Degenerate PCR
HR3	5′-ccagtcctccgtggtgaaYtaYcaRtg-3′	5′-cggggaccatcttggcRaaYtcDat-3′
E75	5′-cgcatcctggccgcNatgcaRca-3′	5′-acttcttgtggggcttgtaggYYtcRtccat-3′
Quantitative RT-PCR
HR3	5′-CGAGGTTCGGTTTCACAGAG-3′	5′-GAGGAGGACGGTTGTTGTTG-3′
E75	5′-GAAATGCCCAGCTACACCAC-3′	5′-GAACTCAACAACCCCACGAA-3′
Timeless	5′-TACAAGCCAGGTCCATCACA-3′	5′-TCAAGCGTCAATTCAGCATC-3′
Clock	5′-ATCGCAAGGGTCTGGAAGTG-3′	5′-GGAAAACTCGCCAAGACAGG-3′
Cycle	5′-CGTGTAATCTGTCGTGTTTGGTG-3′	5′-GAATCGTCCGCCTTTCCTC-3′
rp49	5′-AGTCCGAAGGCGGTTTAAGG-3′	5′-TACAGCGTGTGCGATCTCTG-3′
dsRNA synthesis
HR3#1	5′-TAATACGACTCACTATAGGGACTTCTCCTGCCTCGGGTAT-3′	5′-TAATACGACTCACTATAGGGCAGTTTTAGCTCCGCCAAAC-3′
HR3#2	5′-TAATACGACTCACTATAGGGCGAAAATGGTACCTGGCTTT-3′	5′-TAATACGACTCACTATAGGGTCGCTTGAATTTACCCAAGG-3′
E75#1	5′-TAATACGACTCACTATAGGGAGTCAAAGTCACCCCGAGAA-3′	5′-TAATACGACTCACTATAGGGTCATTAGGCGAGTCCAGCTT-3′
E75#2	5′-TAATACGACTCACTATAGGGCAGAACCAATGGTGGTTTCC-3′	5′-TAATACGACTCACTATAGGGGCCGCTGTTGTTGTAGAGGT-3′
timeless	5′-TAATACGACTCACTATAGGGTGCATTTGGTTGTGACTGCT-3′	5′-TAATACGACTCACTATAGGGAGAGGCGTGTGCCTTGTACT-3′
Clock	5′-TAATACGACTCACTATAGGGACCACCAATCGAAAAATGGA-3′	5′-TAATACGACTCACTATAGGGCCCAGTTCCCACGAAAACTA-3′
cycle	5′-TAATACGACTCACTATAGGGAGGGGCTGTTCATTCCTACA-3′	5′-TAATACGACTCACTATAGGGCGCCCACGACTTCAAATAAC-3′
DsRed2	5′-TAATACGACTCACTATAGGGTCATCACCGAGTTCATGCG-3′	5′-TAATACGACTCACTATAGGGCTACAGGAACAGGTGGTGGC-3′