Skip to main content
. Author manuscript; available in PMC: 2014 Dec 19.
Published in final edited form as: Arch Gen Psychiatry. 2009 May;66(5):488–497. doi: 10.1001/archgenpsychiatry.2009.38

Table 2.

Allele Frequencies and Fst Values for BDNF dbSNPs Shared by Mexican Americans and HapMap Samples

SNP Major/ Minor Allele Minor Allele Frequency (MAF) Fst
Mexican American (MA) HapMap Sample
Cases Controls All CEU YRI HCB+JPT MA vs CEU MA vs YRI MA vs HCB+JPT
rs7124442 T/C 0.23 0.26 0.25 0.37 0.54 0.07 0.03 0.18 0.09
rs6265 G/A 0.10 0.15 0.12 0.18 0.00 0.48 0.01 0.08 0.31
rs11030101 A/T 0.26 0.33 0.29 0.40 0.12 0.31 0.02 0.07 0.00
rs11819808 C/T 0.01 0.00 0.01 0.00 0.28 0.00 0.00 0.45 0.00
rs11030102 C/G 0.17 0.18 0.18 0.29 0.07 0.01 0.04 0.04 0.11
rs12273539 C/T 0.35 0.23 0.29 0.00 0.34 0.13 0.20 0.00 0.06
rs11030104 A/G 0.12 0.15 0.14 0.20 0.00 0.49 0.01 0.08 0.29
rs11030109 G/A 0.02 0.03 0.03 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 0.01
rs988748 C/G 0.15 0.16 0.15 0.22 0.05 0.49 0.01 0.04 0.25
rs4923468 C/A 0.01 0.02 0.02 0.02 0.19 0.02 0.00 0.26 0.00
rs10767664 A/T 0.14 0.16 0.15 0.20 0.04 0.49 0.00 0.04 0.26
rs7931755 A/G 0.01 0.01 0.01 0.00 0.25 0.00 0.00 0.41 0.00
rs2030324 G/A 0.37 0.41 0.39 0.57 0.55 0.56 0.06 0.05 0.05
rs12273363 T/C 0.15 0.16 0.16 0.19 0.07 0.01 0.00 0.03 0.09
rs908867 C/T 0.04 0.05 0.04 0.12 0.10 0.04 0.04 0.03 0.00
rs7931247 C/T 0.37 0.42 0.39 0.57 0.55 0.56 0.06 0.05 0.05
rs12288512 G/A 0.14 0.15 0.15 0.19 0.07 0.01 0.00 0.02 0.09
rs11030123 G/A 0.04 0.05 0.04 0.12 0.10 0.04 0.04 0.02 0.00