Table 2.

Summary of the SSRs and cSSRs observed in the studied alphavirus genomes.

S. No	Species Id	SSR	RA	RD	cSSR	cRA	cRD	cSSR%
1	A1	40	3.38	18.78	0	0.00	0.00	0.00
2	A2	58	5.05	27.68	4	0.35	5.83	6.90
3	A3	41	3.45	24.00	2	0.17	1.85	4.88
4	A4	31	2.72	19.76	2	0.18	3.16	6.45
5	A5	39	3.36	22.48	0	0.00	0.00	0.00
6	A6	33	2.83	18.92	1	0.09	0.86	3.03
7	A7	37	3.25	23.17	3	0.26	4.83	8.11
8	A8	27	2.36	17.42	1	0.09	1.58	3.70
9	A9	41	3.51	23.87	1	0.09	1.63	2.44
10	A10	41	3.55	26.56	1	0.09	1.04	2.44
11	A11	36	3.09	22.90	0	0.00	0.00	0.00
12	A12	35	3.07	21.21	2	0.18	2.98	5.71
13	A13	41	3.51	21.84	1	0.09	1.37	2.44
14	A14	32	2.79	18.58	0	0.00	0.00	0.00
15	A15	42	3.69	24.23	0	0.00	0.00	0.00
16	A16	43	3.68	26.10	1	0.09	1.71	2.33
17	A17	39	3.30	21.55	2	0.17	2.70	5.13
18	A18	52	4.58	29.62	2	0.18	2.38	3.85
19	A19	37	3.22	22.19	0	0.00	0.00	0.00
20	A20	45	3.77	29.29	2	0.17	2.93	4.44
21	A21	46	3.86	26.93	0	0.00	0.00	0.00
22	A22	32	2.80	19.31	1	0.09	1.40	3.13
23	A23	30	2.56	19.85	1	0.09	1.53	3.33
24	A24	43	3.82	27.66	1	0.09	1.16	2.33
25	A25	42	3.64	23.50	2	0.17	2.08	4.76
26	A26	37	3.07	21.99	3	0.25	4.15	8.11
27	A27	38	3.18	27.75	1	0.08	1.09	2.63
28	A28	39	3.41	23.24	1	0.09	2.53	2.56
29	A29	35	3.03	20.69	1	0.09	1.30	2.86
30	A30	28	2.41	19.63	3	0.26	4.56	10.71