Table 2.
Linkage disequilibrium of Malawi, Zimbabwe, South African Field (SAField) village chickens and the Naked Neck (NN), Venda (VD), Potchefstroom Koekoek (PK) and Ovambo (OV) conservation flocks.
| Linkage Disequilibrium (r2) | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Malawi | Zimbabwe | SAField | NN | VD | PK | OV | |
| 1 | 0.09±0.14 | 0.05±0.10 | 0.05±0.10 | 0.23±0.26 | 0.26±0.28 | 0.17±0.21 | 0.21±0.23 |
| 2 | 0.9±0.14 | 0.05±0.10 | 0.06±0.11 | 0.22±0.25 | 0.27±0.29 | 0.17±0.21 | 0.21±0.24 |
| 3 | 0.09±0.14 | 0.05±0.09 | 0.05±0.09 | 0.24±0.26 | 0.26±0.28 | 0.17±0.21 | 0.20±0.22 |
| 4 | 0.09±0.14 | 0.05±0.10 | 0.06±0.10 | 0.23±0.26 | 0.26±0.29 | 0.16±0.20 | 0.21±0.23 |
| 5 | 0.08±0.13 | 0.05±0.09 | 0.06±0.10 | 0.23±0.27 | 0.24±0.26 | 0.16±0.20 | 0.21±0.22 |
| 6 | 0.08±0.12 | 0.04±0.08 | 0.05±0.08 | 0.24±0.26 | 0.25±0.26 | 0.17±0.21 | 0.22±0.23 |
| 7 | 0.09±0.14 | 0.05±0.10 | 0.05±0.10 | 0.23±0.26 | 0.26±0.29 | 0.16±0.20 | 0.20±0.22 |
| 8 | 0.11±0.17 | 0.07±0.15 | 0.07±0.15 | 0.23±0.26 | 0.28±0.29 | 0.21±0.26 | 0.22±0.25 |
| 9 | 0.08±0.12 | 0.04±0.08 | 0.05±0.08 | 0.19±0.22 | 0.22±0.26 | 0.16±0.20 | 0.20±0.22 |
| 10 | 0.08±0.12 | 0.04±0.09 | 0.05±0.09 | 0.21±0.24 | 0.28±0.31 | 0.18±0.22 | 0.20±0.20 |
| 11 | 0.9±0.14 | 0.06±0.11 | 0.06±0.12 | 0.28±0.29 | 0.22±0.33 | 0.23±0.26 | 0.20±0.23 |
| 12 | 0.09±0.12 | 0.05±0.09 | 0.05±0.09 | 0.24±0.27 | 0.33±0.33 | 0.17±0.21 | 0.22±0.23 |
| 13 | 0.09±0.13 | 0.05±0.09 | 0.05±0.09 | 0.23±0.26 | 0.26±0.28 | 0.18±0.22 | 0.22±0.23 |
| 14 | 0.10±0.15 | 0.05±0.10 | 0.05±0.10 | 0.22±0.25 | 0.24±0.28 | 0.17±0.21 | 0.21±0.23 |
| 15 | 0.10±0.15 | 0.07±0.12 | 0.07±0.12 | 0.25±0.27 | 0.26±0.28 | 0.18±0.23 | 0.23±0.24 |
| 16 | 0.10±0.15 | 0.04±0.08 | 0.12±0.14 | 0.27±0.28 | 0.58±0.41 | 0.23±0.28 | 0.25±0.27 |
| 17 | 0.09±0.14 | 0.05±0.11 | 0.06±0.11 | 0.24±0.27 | 0.24±0.27 | 0.18±0.22 | 0.22±0.24 |
| 18 | 0.08±0.11 | 0.04±0.08 | 0.04±0.07 | 0.23±0.26 | 0.22±0.26 | 0.17±0.21 | 0.20±0.22 |
| 19 | 0.08±0.11 | 0.04±0.09 | 0.04±0.09 | 0.21±0.23 | 0.22±0.25 | 0.17±0.22 | 0.19±0.21 |
| 20 | 0.09±0.14 | 0.05±0.10 | 0.06±0.11 | 0.22±0.26 | 0.32±0.31 | 0.21±0.25 | 0.19±0.21 |
| 21 | 0.09±0.13 | 0.05±0.09 | 0.05±0.09 | 0.21±0.25 | 0.30±0.30 | 0.18±0.22 | 0.19±0.21 |
| 22 | 0.08±0.13 | 0.05±0.09 | 0.05±0.11 | 0.21±0.25 | 0.25±0.29 | 0.16±0.21 | 0.19±0.22 |
| 23 | 0.08±0.11 | 0.03±0.07 | 0.04±0.08 | 0.27±0.29 | 0.23±0.27 | 0.16±0.21 | 0.19±0.22 |
| 24 | 0.08±0.11 | 0.04±0.09 | 0.04±0.09 | 0.20±0.21 | 0.24±0.27 | 0.14±0.18 | 0.21±0.22 |
| 25 | 0.07±0.14 | 0.03±0.07 | 0.04±0.07 | 0.17±0.21 | 0.17±0.22 | 0.15±0.20 | 0.19±0.21 |
| 26 | 0.07±0.11 | 0.04±0.07 | 0.04±0.07 | 0.23±0.26 | 0.20±0.23 | 0.17±0.21 | 0.18±0.19 |
| 27 | 0.09±0.14 | 0.04±0.10 | 0.05±0.09 | 0.22±0.25 | 0.21±0.26 | 0.17±0.21 | 0.21±0.23 |
| 28 | 0.09±0.13 | 0.05±0.10 | 0.05±0.10 | 0.19±0.22 | 0.25±0.29 | 0.16±0.21 | 0.18±0.21 |