TABLE 1.

Endonucleolytic cleavage of IAV RNAs

IAV RNA and strand	No. of cDNA reads		% of total cDNA reads
	Control shRNA	RNase L shRNA	Control shRNA	RNase L shRNA	Fold change
PB2
−	689	383	2.17	0.87	2.48
+	30	12	0.09	0.03	3.45
PB1
−	748	313	2.36	0.71	3.29
+	177	54	0.56	0.12	4.52
PA
−	471	199	1.48	0.45	3.26
+	7	11	0.02	0.03	0.88
HA
−	50	30	0.16	0.07	2.30
+	59	39	0.19	0.09	2.09
NP
−	28	12	0.09	0.03	3.22
+	225	89	0.71	0.20	3.49
NA
−	27	19	0.09	0.04	1.96
+	3	3	0.01	0.01	1.38
M
−	121	45	0.38	0.10	3.71
+	595	128	1.87	0.29	6.41
ΔNS1
−	6	8	0.02	0.02	1.03
+	14	3	0.04	0.01	6.43
Sum
−	2,140	1,009	6.74	2.30	2.92
+	1,096	336	3.50	0.77	4.51
Total	3,250	1,348	10.23	3.08	3.32