TABLE 1.
Primers for qPCR
Gene | Forward primer (5′–3′) | Reverse primer (5′–3′) |
---|---|---|
Cdk1 | 5′-AAACTGGCTGATTTCGGCC-3′ | 5′-AGCAACACTTCTGGAGATCGGT-3′ |
Cdk2 | 5′-AATTCATGGATGCCTCTGCTCT-3′ | 5′-CACGGTGAGAATGGCAGAA-3′ |
Cdk4 | 5′-CCTGCCGGTTGAGACCAT-3′ | 5′-AGAAAATCCAGGCCGCTTAG-3′ |
Cullin1 | 5′-CCCTGGTGATGTCAGCATTCA-3′ | 5′-GGCCATTTTGGTAACCGCA-3′ |
Cyclin A2 (Ccna2) | 5′-TGTGAAGATGCCCTGGCTTT-3′ | 5′-CATGTGGTGATTCAAAACTGCC-3′ |
Cyclin B1 (Ccnb1) | 5′-TTAGGCTGCTTCAGGAGACCAT-3′ | 5′-TACACCGACCAGCTGTAGCATC-3′ |
Cyclin D1 (Ccnd1) | 5′-GCCGAGAAGTTGTGCATCTACA-3′ | 5′-TGTTCACCAGAAGCAGTTCCATT-3′ |
Cyclin E1 (Ccne1) | 5′-TCTCCTCACTGGAGTTGATGCA-3′ | 5′-AACGGAACCATCCATTTGACA-3′ |
FBXL10-1 (Kdm2b) | 5′-ATGGAGGCAGAGAAAGAC-3′ | 5′-CACGTCCGACAAGTCTTCGTT-3′ |
FBXL10-2 (Kdm2b) | 5′-GCCGAGGACGACGACTATGAA-3′ | 5′-CAAAAGTGGCACTCTCCACA-3′ |
FBXL10-all subtypes | 5′-TTGCTCAAGGAGCAGAAGATGAAC-3′ | 5′-GAGGCTCGCTTGCGTCCA-3′ |
p15Ink4b (Cdkn2b) | 5′-GATCCCAACGCCCTGAA-3′ | 5′-GGCGCAGTTGGGTTCTG-3′ |
p16Ink4a (Cdkn2a) | 5′-GCTCTGGCTTTCGTGAACATG-3′ | 5′-CGTGAACGTTGCCCATCAT-3′ |
p21Cip1 (Cdkn1a) | 5′-TCTCAGGGCCGAAAACG-3′ | 5′-AATCTGCGCTTGGAGTGATAGA-3′ |
p27Kip1 (Cdkn1b) | 5′-TGGACCAAATGCCTGACTCGT-3′ | 5′-GCCCTTTTGTTTTGCGAAGAAG-3′ |
Pparg1 | 5′-CTGCGTAACTGACAGCCTAAC-3′ | 5′-ACTTGGTCACTCTCCGTCCT-3′ |
Pparg2 | 5′-CTGGGAGATTCTCCTGTTGACC-3′ | 5′-CCTTGCAGCAACATCAGGAA-3′ |
Ppib | 5′-GCAAAGTTCTAGAGGGCATGG-3′ | 5′-CAGCTGCTTAGAGGGATGAGG-3′ |
Ring1b (Rnf2) | 5′-GTATGAAGCGCATCAGGAAAGG-3′ | 5′-CGCTGTAATCTGTTCATGGCCT-3′ |
Skp1a | 5′-CTCCTCCTCCTGAGGATGATG-3′ | 5′-GGCCACAGTCTTGCATGTGAC-3′ |