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. Author manuscript; available in PMC: 2015 Feb 16.
Published in final edited form as: Inflamm Bowel Dis. 2013 Mar;19(3):512–525. doi: 10.1097/MIB.0b013e31828028ad

Table 1.

Real-time quantitative reverse transcription- PCR (RT-PCR) Primers

Gene Forward Reverse
STAT3 Signaling
IL-6 5′-CAAAGCCAGAGTCCTTCAGAGAGATAC-3′ 5′-ATTGGATGGTCTTGGTCCTTAGC-3′
IL-10 5′-GGT TGCCAAGCCTTATCGGA-3′ 5′-ACCTGCTCCACTGCCTTATCGGA-3′
SOCS3 5′-GCTCCAAAAGCGAGTACCAGC-3′ 5′-AGTAGAATCCGCTCTCCTGCAG-3′
RegIIIβ 5′-TCCCAGGCTTATGGCTCC TA-3′ 5′-GCAGGCCAGTTCTGC ATC A-3′
RegIIIγ 5′-TTCCTGTCCTCCATGATCAAAA-3′ 5′-CATCCACCTCTGTTGGGTTCA-3′
p65 Signaling
IκBα 5′-TGGCGAGGTCTGACTGTTGTGG-3′ 5′-GCTCATCAAAAAGTTCCCTGTGC-3′
Cytokines
IL-4 5′-TGTACCAGGAGCCATATCCAC-3′ 5‘-GTTCTTCGTTGCTGTGAGGAC-3′
IL-1β 5′-CAGAGTTCCCCAACTGGTACAT-3′ 5′-AAGGAGGAAACACAGGCTCTCT-3′
IFNγ 5′-CATTCATGAGTATTGCCAAGTTTG-3′ 5′-GCTGGATTCCGGCAACAG-3′
TNFα 5′-AGGCAGGTTCTGTCCCTTTCA-3′ 5′-AGATAGCAAATCGGCTGACGG-3′
IL-17A 5′- GCTCCAGAAGGCCCTCAGA-3′ 5′-AGCTTTCCCTCCGCATTGA-3′
Chemokines
CXCL1/KC 5′-CCCAAACCGAAGTCATAGCCACAC-3′ 5′-TTGTCAGAAGCCAGCGTTCACCAG-3′
CXCL2 / MIP-2 5′-GGCTGTTGTGGCCAGTGAA-3′ 5′-TGTTCAGTATCTTTTGGATGATTTTCTG-3′
CXCL5 / Lix 5′-AGCTGCGTTGTGTTTGCTTAACCG-3′ 5′-TTGAACACTGGCCGTTCTTTCCAC-3′
CXCL10 5′-GCCGTCATTTTCTGCCTCAT-3′ 5′-GCTTCCCTATGGCCCTCATT-3′
CCL2/MCP-1 5′-CACCCCATTACATCTCTTCCCC-3′ 5′-TGTTTCCCTCTCACTTCACTCTGT-3′
CCL4/MIP-1β 5′-GCCCTCTCTCTCCTCTTGCT-3′ 5′-GAGGGTCAGAGCCCATTG-3′
CCL5 5′-TTGCCTACCTCTCCCTCGCGC-3′ 5′-GGTTCCTTCGAGTGACAAACA-3′
CCL20 5′-GGTGGCAAGCGTCTGCTC-3′ 5′-GCCTGGCTGCAGAGGTGA-3′
S100 products
S100A8 5′- AGTGTCCTCAGTTTGTGCAG-3′ 5′-ATCCCTTGTGGCTGTCTTTG-3′
S100A9 5′-GTTGATCTTTGCCTGTCATGAG-3′ 5′-AGCCATTCCCTTTAGACTTGG-3′
Receptors
CXCR2 5′-AGCAAACACCTCTACTACCCTCTA-3′ 5′-GGGCTGCATCAATTCAAATACCA-3′