Table 1. Association between Polymorphisms of the Genes Specifying DA and 5-HT Neurons and Psychiatric Disorders.

Gene List	Number of genes	Pval. BPD	Pval. SCZ	Pval. MDD
Dopaminergic specification
BDNF (Baquet et al, 2005), CDH2 (Sakane and Miyamoto, 2013), CTNNB1 (Tang et al, 2010), DKK1 (Ribeiro et al, 2011), EGFR (Iwakura et al, 2011), EN1 (Alberi et al, 2004; Alves dos Santos and Smidt, 2011; Ellisor et al, 2012; Simon et al, 2001), EN2 (Ellisor et al, 2012; Simon et al, 2001), FERD3L (Ono et al, 2010), FGF2 (Ratzka et al, 2012), FGFR1 (Lahti et al, 2012), FGFR2 (Lahti et al, 2012), FOXA1 (Ferri et al, 2007), FOXA2 (Ferri et al, 2007; Hynes et al, 1995), GDNF (Kholodilov et al, 2004), GLI1 (Hynes et al, 1997), GLI2 (Matise et al, 1998a), LMX1A (Andersson et al, 2006b; Deng et al, 2011), LMX1B (Deng et al, 2011; Smidt et al, 2000), MSX1 (Andersson et al, 2006b), NEUROG2 (Andersson et al, 2006a; Kele et al, 2006), NR4A2 (Zetterstrom et al, 1997), ONECUT1 (Chakrabarty et al, 2012), ONECUT2 (Chakrabarty et al, 2012), OTX2 (Brodski et al, 2003; Omodei et al, 2008), PHOX2B (Deng et al, 2011; Hoekstra et al, 2012), PITX3 (Smidt et al, 2004), RSPO1 (Hoekstra et al, 2013), SHH (Joksimovic et al, 2009), SMO (Hynes et al, 2000a), TGFA (Blum, 1998), UNCX (Rabe et al, 2012), WNT1 (Alves dos Santos and Smidt, 2011; Ellisor et al, 2012; Prakash et al, 2006), WNT2 (Sousa et al, 2010), WNT5A (Andersson et al, 2008)	34	0.011 0.033a	1	1
Dopaminergic specification (Hegarty et al, 2013)
CTNNB1, DKK1, EN1, EN2, FERD3L, FGF2, FGFR1, FOXA2, FZD3, FZD6, GLI1, GLI2, HES1, LMX1A, LMX1B, LRP6, NEUROG2, NR4A2, ONECUT1, ONECUT2, OTX2, PAX2, PAX5, PITX3, WNT1, WNT2	26	0.025 0.042a	1	1
Serotonergic specification
ASCL1 (Pattyn et al, 2004), EN1 (Fox and Deneris, 2012; Simon et al, 2005), EN2 (Fox and Deneris, 2012), FOXA2 (Jacob et al, 2007), GATA2 (Craven et al, 2004), GATA3 (van Doorninck et al, 1999), GLI1 (Hynes et al, 1997), GLI2 (Matise et al, 1998b), INSM1 (Jacob et al, 2009), LMX1B (Ding et al, 2003), STXBP1 (Dudok et al, 2011), NKX2-2 (Briscoe et al, 1999), OTX2 (Brodski et al, 2003), FEV (Hendricks et al, 2003), PHOX2B (Pattyn et al, 2003), SIM1 (Osterberg et al, 2011), SHH (Hynes et al, 1997), SMO (Hynes et al, 2000b), WNT1 (Simon et al, 2005)	19	0.028	1	1

^aFDR corrected p-values; Abbreviations: MDD, major depressive disorder; SCZ, schizophrenia. For the references see the supplement.