Table 7.
MaSH values calculated for the ML trees inferred in this study
| Subtree | 16S rRNA gene | Full supermatrix | MARE supermatrix | Core-gene supermatrix | Gene content | Ortholog content |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
S. acidiphila, S. rosea* |
0.027 |
~ |
~ |
~ |
~ |
~ |
|
B. cremea*, B. marina |
0.032 |
~ |
~ |
~ |
~ |
~ |
|
P. brasiliensis, P. maris |
0.072 |
0.414 |
0.272 |
0.287 |
0.166 |
0.185 |
|
P. limnophilus, Sc. |
0.074 |
0.382 |
0.240 |
0.245 |
0.193 |
0.215 |
|
Te.*, Za. |
0.086 |
~ |
~ |
~ |
~ |
~ |
|
Aq.*, Is. |
0.090 |
~ |
~ |
~ |
~ |
~ |
|
Aq.*, Is., S. acidiphila, S. rosea* |
0.100 |
0.422 |
0.305 |
0.309 |
0.177 |
0.209 |
|
B. cremea*, B. marina, Pi. |
0.101 |
0.378 |
0.272 |
0.267 |
0.164 |
0.171 |
|
Ge., Te.*, Za. |
0.119 |
0.346 |
0.280 |
0.275 |
0.213 |
0.236 |
|
Pl., Sc. |
0.121 |
0.480 |
0.338 |
0.333 |
0.198 |
0.220 |
|
B. cremea*, B. marina, Pi., Rh. |
0.125 |
0.539 |
0.353 |
0.382 |
0.379 |
0.347 |
|
Aq.*, Ge., Is., S. acidiphila, S. rosea*, Te.*, Za. |
0.245 |
0.633 |
0.579 |
0.522 |
0.381 |
0.448 |
|
Aq.*, Ge., Is., Pl., Sc., S. acidiphila, S. rosea*, Te.*, Za. |
0.297 |
0.658 |
0.523 |
0.522 |
0.410 |
0.382 |
|
Aq.*, B. cremea*, B. marina, Ge., Is., Pi., Pl., Rh., Sc., S. acidiphila, S. rosea*, Te.*, Za. |
0.308 |
0.734 |
0.682 |
0.588 |
0.427 |
0.495 |
| Aq.*, B. cremea*, B. marina, Ge., Is., Ph., Pi., Pl., Rh., Sc., S. acidiphila, S. rosea*, Te.*, Za. | 0.639 | 1.258 | 1.118 | 1.082 | 0.558 | 0.649 |
*Indicate organisms that were only present in the 16S rRNA gene tree.