Table A1.
Gene expression profiles of co-cultivated A549 cells and EC exposed to alpha particles (1 Gy). Total RNA was extracted 24 h after radiation exposure and retrotranscribed before being hybridized onto TaqMan low-density array human immune as described in Materials and Methods. Results are presented in induction fold by comparison with the reference condition. both cell types non-irradiated. NE: not expressed i.e., Ct value > 35 or undetermined. * = irradiated cells.
| Gene Symbol | A549 cell gene expression | EC gene expression | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 Gy A549*/EC* | 1 Gy A549*/EC | 1 Gy A549/EC* | 1 Gy A549*/EC* | 1 Gy A549*/EC | 1 Gy A549/EC* | |
| ACE | NE | 1.2 | 0.8 | NE | NE | NE |
| AGTR1 | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| AGTR2 | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| BAX | 0.8 | 2.1 | 0.9 | 1.1 | 1.0 | 1.6 |
| BCL2 | 1.0 | 1.1 | 2.0 | NE | 1.1 | NE |
| BCL2L1 | 2.5 | 2.7 | 0.6 | 1.5 | 1.2 | 2.1 |
| C3 | 2.1 | 2.2 | 0.7 | NE | NE | NE |
| CCL19 | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| CCL2 | 2.0 | 2.4 | 5.2 | 1.2 | 1.5 | 1.3 |
| CCL3 | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| CCL5 | 1.8 | 2.0 | 1.2 | 1.5 | 3.9 | 0.9 |
| CCR2 | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| CCR4 | NE | NE | NE | 0.5 | 0.7 | 0.8 |
| CCR5 | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| CCR7 | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| CD19 | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| CD28 | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| CD34 | NE | NE | NE | 0.8 | NE | 1.3 |
| CD38 | 1.9 | 2.1 | 0.9 | NE | NE | NE |
| CD3E | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| CD4 | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| CD40 | 1.4 | 2.4 | 1.8 | 1.2 | 0.9 | 1.4 |
| CD40LG | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| CD68 | 1.2 | 2.0 | 1.0 | 0.9 | 1.0 | 1.4 |
| CD80 | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| CD86 | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| CD8A | 0.5 | 0.5 | 0.5 | NE | NE | NE |
| COL4A5 | 2.0 | 2.3 | 0.6 | 1.0 | 0.9 | 1.3 |
| CSF1 | 2.0 | 2.1 | 1.0 | 1.3 | 1.6 | 1.3 |
| CSF2 | 9.5 | 3.4 | 2.7 | 0.9 | 0.9 | 1.1 |
| CSF3 | NE | NE | NE | 1.5 | 1.7 | 1.8 |
| CTLA4 | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| CXCL10 | 3.4 | 4.4 | 1.1 | 10.5 | 5.5 | 7.8 |
| CXCL11 | 1.2 | 2.1 | 0.9 | 7.3 | 4.7 | 3.2 |
| CXCR3 | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| CYP1A2 | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| CYP7A1 | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| ECE1 | 1.2 | 1.3 | 0.6 | 0.9 | 0.8 | 1.1 |
| EDN1 | 1.4 | 1.3 | 0.9 | 1.0 | 0.8 | 1.0 |
| FAS | 6.4 | 5.0 | 1.0 | 1.4 | 0.8 | 1.2 |
| FASLG | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| FN1 | 1.1 | 1.4 | 0.9 | 1.4 | 2.1 | 1.3 |
| GNLY | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| GZMB | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| HLA-DRA | NE | 1.1 | 1.0 | 0.9 | 0.8 | 1.0 |
| HLA-DRB1 | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| HMOX1 | 0.0 | 1.3 | 1.1 | 1.8 | 2.1 | 1.2 |
| ICAM1 | NE | 1.7 | 1.1 | 0.8 | 0.8 | 0.5 |
| ICOS | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| IFNG | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| IKBKB | 0.8 | 0.8 | 0.6 | 0.7 | 0.9 | 0.8 |
| IL10 | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| IL12A | 1.7 | 0.9 | 0.9 | 1.9 | 1.3 | 1.4 |
| IL12B | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| IL13 | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| IL15 | NE | NE | NE | 1.1 | 1.1 | NE |
| IL17 | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| IL18 | 1.3 | 2.1 | 2.1 | 0.7 | 0.8 | 1.3 |
| IL1A | 2.6 | 2.5 | 1.5 | 0.9 | 0.8 | 0.7 |
| IL1B | 3.0 | 3.1 | 0.7 | 0.8 | 1.0 | 0.6 |
| IL2 | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| IL2RA | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| IL3 | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| IL4 | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| IL5 | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| IL6 | 3.1 | 3.1 | 1.3 | 1.1 | 1.1 | 1.2 |
| IL7 | NE | NE | NE | 1.1 | 1.3 | NE |
| IL8 | 1.8 | 1.7 | 1.0 | 0.5 | 1.5 | 0.4 |
| IL9 | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| LRP2 | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| LTA | NE | NE | NE | 8.2 | 5.8 | 8.7 |
| MYH6 | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| NFKB2 | 1.4 | 1.4 | 0.9 | 0.8 | 1.1 | 0.6 |
| NOS2A | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| PRF1 | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| PTGS2 | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| PTPRC | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| REN | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| RPL3L | NE | NE | NE | 0.4 | 0.3 | 0.4 |
| SELE | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| SELP | NE | NE | NE | 0.9 | 0.8 | 0.9 |
| SKI | 0.8 | 1.0 | 0.9 | 0.7 | 0.9 | 1.2 |
| SMAD3 | 0.7 | 0.6 | 0.4 | 1.0 | 0.9 | 1.4 |
| SMAD7 | 0.9 | 1.1 | 1.2 | 0.5 | 0.9 | 0.4 |
| STAT3 | 1.3 | 1.6 | 0.8 | 1.0 | 0.9 | 1.5 |
| TBX21 | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| TGFB1 | 1.0 | 1.2 | 0.8 | NE | NE | NE |
| TNF | 1.6 | 1.1 | NE | NE | NE | NE |
| TNFRSF18 | NE | NE | NE | NE | NE | NE |
| VEGF | 1.2 | 1.4 | 1.0 | 1.2 | 1.0 | 1.0 |