Skip to main content
. 2015 Apr 2;47(1):26. doi: 10.1186/s12711-015-0114-8

Table 4.

Average weighted accuracies of predicted phenotypic values across breeds for the 5-fold cross-validation populations based on the GBLUP model without dominance (GRM) and with dominance (GRM + DRM)

Trait 1 AA BB BR BX HH MG SG SS TC ALL (SD)
GRM
PW_hip 0.12 0.33 0.24 0.17 0.16 0.15 0.34 0.275 (0.090)
PW_lwt 0.17 0.28 0.18 0.20 0.14 0.14 0.07 0.29 0.223 (0.072)
X_lwt 0.21 0.20 0.21 0.23 0.22 0.22 0.21 0.33 0.227 (0.043)
PWIGF 0.13 0.07 0.102 (0.047)
CIMF 0.15 0.17 0.27 0.18 0.13 0.21 0.23 0.17 0.24 0.190 (0.046)
CRBY 0.18 0.15 −0.01 −0.04 0.14 0.17 0.117 (0.098)
SC12 0.32 0.318
PNS24 0.23 0.233
AGECL 0.33 0.20 0.260 (0.090)
Mean 0.16 0.24 0.18 0.21 0.12 0.21 0.18 0.15 0.25 0.216 (0.039)
GRM + DOM
PW_hip 0.13 0.33 0.25 0.16 0.17 0.15 0.34 0.275 (0.088)
PW_lwt 0.16 0.27 0.18 0.23 0.12 0.16 0.06 0.29 0.222 (0.078)
X_lwt 0.21 0.20 0.21 0.25 0.20 0.22 0.21 0.34 0.227 (0.047)
PWIGF 0.15 0.06 0.109 (0.059)
CIMF 0.13 0.15 0.27 0.17 0.13 0.20 0.22 0.15 0.24 0.179 (0.050)
CRBY 0.18 0.17 0.02 −0.03 0.13 0.16 0.121 (0.090)
SC12 0.31 0.314
PNS24 0.23 0.231
AGECL 0.33 0.20 0.257 (0.092)
Mean 0.16 0.24 0.19 0.22 0.12 0.20 0.18 0.15 0.24 0.215 (0.072)

Cells without values are cases for which they could be not estimated or they were removed when the number of records was less than 200 for the given trait; SD = standard deviation of accuracies across breeds; 1trait abbreviations are in Table 1.