Skip to main content
. 2015 Apr 13;10(4):e0118660. doi: 10.1371/journal.pone.0118660

Table 3. GST M1-T1 null allele frequency based genetic distance between 45 geographically assorted human populations (GAHPs).

S. No. GAHPs eAf_Zim sAf_Nam Ind_Guj sAf_Xho Ind_Tn Ind_Kar Ind_Wb mAf_Cam Ind_Mah wAf_Nig Ind_Ker Ind_Up Ind_Ap sAm_Brz
1 eAf_Zim
2 sAf_Nam 0.019641
3 Ind_Guj 0.008566 0.004982
4 sAf_Xho 0.018002 0.007702 0.002144
5 Ind_Tn 0.003500 0.033450 0.022055 0.037140
6 Ind_Kar 0.003729 0.037771 0.023632 0.038408 0.000355
7 Ind_Wb 0.012420 0.058122 0.041785 0.061245 0.003252 0.002526
8 mAf_Cam 0.036741 0.028132 0.014999 0.006642 0.063507 0.062461 0.090338
9 Ind_Mah 0.013628 0.064129 0.044263 0.063067 0.004934 0.003307 0.000574 0.088816
10 wAf_Nig 0.011698 0.025018 0.007718 0.007576 0.026876 0.025085 0.042346 0.009135 0.040441
11 Ind_Ker 0.018509 0.075817 0.052630 0.072183 0.008654 0.006243 0.002038 0.096709 0.000540 0.045207
12 Ind_Up 0.011897 0.062884 0.039784 0.055683 0.006375 0.003826 0.003100 0.075196 0.001229 0.031146 0.001306
13 Ind_Ap 0.011155 0.056511 0.029903 0.039082 0.013492 0.009762 0.014788 0.047057 0.011066 0.014791 0.011238 0.005068
14 sAm_Brz 0.019686 0.071517 0.039623 0.047429 0.023229 0.018123 0.023228 0.050077 0.017729 0.017980 0.016579 0.009579 0.001318
15 eAf_Som 0.047449 0.069856 0.039132 0.031371 0.071354 0.065680 0.087771 0.014241 0.080505 0.013198 0.082462 0.062745 0.031855 0.027019
16 sAs_Iran 0.033673 0.067958 0.035776 0.033278 0.050368 0.044624 0.060441 0.022080 0.053470 0.010096 0.054000 0.038840 0.015631 0.011558
17 seAs_Vie 0.027183 0.078906 0.043887 0.048612 0.034281 0.028238 0.035694 0.045118 0.028849 0.017602 0.027294 0.018065 0.004738 0.001318
18 eAf_Eth 0.041147 0.083845 0.047123 0.045069 0.056782 0.049923 0.064060 0.031565 0.055751 0.016495 0.054832 0.040296 0.016788 0.010910
19 sAs_Pak 0.037341 0.107807 0.067666 0.078333 0.036617 0.029669 0.029982 0.079443 0.022419 0.037756 0.018481 0.013929 0.007683 0.003628
20 sAs_Afg 0.044754 0.124665 0.082681 0.097123 0.039341 0.032172 0.028470 0.102102 0.020874 0.052050 0.015882 0.014104 0.012496 0.008620
21 eAs_Mon 0.041766 0.111479 0.069331 0.077606 0.043779 0.036213 0.038385 0.074231 0.029918 0.036336 0.025780 0.019540 0.009564 0.004097
22 nEu_Fin 0.056413 0.147166 0.103438 0.122646 0.045284 0.037978 0.029516 0.132931 0.022041 0.072547 0.015927 0.017497 0.021698 0.018273
23 sEu_Ita 0.061485 0.153594 0.106118 0.122436 0.053407 0.045069 0.038414 0.126364 0.029524 0.070064 0.022816 0.022503 0.022062 0.016456
24 eEu_Rus 0.059262 0.147482 0.099679 0.113354 0.054266 0.045694 0.041407 0.113525 0.032070 0.062336 0.025631 0.023486 0.019501 0.013120
25 eAs_Jap 0.110350 0.146520 0.099722 0.084594 0.142570 0.132315 0.158417 0.048140 0.144938 0.053266 0.143253 0.118214 0.072885 0.059379
26 wEu_Ned 0.059823 0.144141 0.095375 0.105798 0.058632 0.049635 0.048197 0.101024 0.038141 0.055834 0.031893 0.027464 0.018923 0.011362
27 sEu_Spa 0.060246 0.145849 0.097044 0.108186 0.058185 0.049224 0.047092 0.104342 0.037126 0.057711 0.030768 0.026857 0.019275 0.011877
28 eEu_Pol 0.065713 0.157598 0.107503 0.121115 0.060599 0.051493 0.046757 0.119726 0.036775 0.067624 0.029742 0.027621 0.023028 0.015739
29 eEu_Slk 0.067544 0.161727 0.111408 0.126171 0.061054 0.051968 0.046119 0.126173 0.036234 0.071687 0.028989 0.027678 0.024546 0.017452
30 wEu_Ger 0.070266 0.166596 0.115586 0.130954 0.063009 0.053801 0.047246 0.131318 0.037254 0.075319 0.029750 0.028878 0.026377 0.019164
31 seAs_Phi 0.070253 0.140613 0.090160 0.090823 0.080995 0.070962 0.078774 0.072213 0.066801 0.045336 0.061492 0.049833 0.027442 0.016743
32 eEu_Bul 0.072759 0.171473 0.120080 0.136502 0.064240 0.055011 0.047413 0.138030 0.037460 0.079764 0.029721 0.029583 0.028364 0.021260
33 sEu_Sln 0.066941 0.151257 0.099936 0.107876 0.068535 0.058783 0.059143 0.098202 0.048016 0.056728 0.041428 0.035289 0.022831 0.013657
34 sEu_Gre 0.084181 0.192766 0.140787 0.162602 0.069434 0.060400 0.047888 0.171015 0.038494 0.101709 0.029929 0.033419 0.038936 0.032905
35 eAs_Kor 0.131072 0.171461 0.120063 0.103009 0.165454 0.153899 0.180971 0.061388 0.165744 0.067925 0.162999 0.136593 0.087477 0.071632
36 wAs_Cau 0.114150 0.162684 0.110741 0.097673 0.142911 0.131528 0.153814 0.060689 0.139138 0.059434 0.135556 0.112713 0.069730 0.054782
37 wEu_Fra 0.079786 0.181720 0.127681 0.143431 0.071836 0.061962 0.054405 0.142357 0.043640 0.084247 0.035309 0.034781 0.032085 0.023807
38 eAs_Chi 0.107068 0.162350 0.109199 0.098764 0.132097 0.120617 0.139605 0.064352 0.125031 0.057523 0.120667 0.100165 0.060995 0.046306
39 nEu_Dnk 0.086463 0.194885 0.140372 0.159569 0.074495 0.064731 0.053988 0.162804 0.043567 0.097621 0.034687 0.036500 0.038115 0.030493
40 nEu_Swd 0.088823 0.197255 0.141108 0.158695 0.078575 0.068343 0.058687 0.158719 0.047608 0.096026 0.038515 0.039288 0.038475 0.029849
41 nAf_Egt 0.087395 0.174577 0.117293 0.121158 0.093461 0.082045 0.085005 0.102434 0.071600 0.066203 0.063981 0.055069 0.035784 0.023311
42 seAs_Ids 0.110068 0.176501 0.119385 0.111506 0.131239 0.118996 0.134139 0.077907 0.118852 0.064351 0.112960 0.094840 0.058800 0.043301
43 eEu_Cze 0.093352 0.195596 0.135981 0.146458 0.091159 0.079672 0.075757 0.134876 0.062724 0.084693 0.053635 0.049608 0.038780 0.027114
44 nEu_Uk 0.100862 0.209262 0.147632 0.159813 0.096473 0.084651 0.078719 0.149197 0.065400 0.094779 0.055589 0.052818 0.043805 0.031824
45 seAs_S_M 0.171196 0.272027 0.195663 0.189285 0.188418 0.171818 0.180613 0.146069 0.160261 0.120939 0.148990 0.133165 0.096023 0.074061

The values represented in the table were computed between the population affiliations by Nei’s (1972) standard genetic distance (DST) method and were used in phylogenetic tree of 45 geographically assorted human populations for GST M1-T1 null allele frequency (Fig. 2). Abbreviations used were same as those in Table 1.