Table 3.
Rhesus chromosome no. | No. of SNPs | Mean gap (kb) | Median gap (kb) | Chinese MAF | Indian MAF | Cynomolgus MAF |
1 | 155 | 1441.33 | 1091.03 | 0.219 | 0.268 | 0.085 |
2 | 134 | 1402.99 | 1090.18 | 0.207 | 0.270 | 0.074 |
3 | 121 | 1629.82 | 991.86 | 0.196 | 0.280 | 0.101 |
4 | 98 | 1685.48 | 1352.60 | 0.201 | 0.287 | 0.096 |
5 | 142 | 1276.63 | 908.09 | 0.205 | 0.252 | 0.076 |
6 | 118 | 1499.34 | 1024.29 | 0.201 | 0.288 | 0.081 |
7 | 126 | 1346.33 | 1007.58 | 0.203 | 0.266 | 0.085 |
8 | 104 | 1424.05 | 1011.12 | 0.169 | 0.262 | 0.099 |
9 | 94 | 1408.11 | 1126.77 | 0.214 | 0.269 | 0.085 |
10 | 68 | 1338.31 | 1147.22 | 0.192 | 0.304 | 0.076 |
11 | 93 | 1392.85 | 954.30 | 0.209 | 0.274 | 0.085 |
12 | 54 | 1863.75 | 1397.68 | 0.215 | 0.270 | 0.068 |
13 | 100 | 1361.55 | 850.08 | 0.205 | 0.260 | 0.087 |
14 | 73 | 1831.24 | 1404.06 | 0.222 | 0.262 | 0.099 |
15 | 68 | 1606.46 | 1355.44 | 0.171 | 0.268 | 0.079 |
16 | 46 | 1717.69 | 1496.39 | 0.198 | 0.274 | 0.130 |
17 | 74 | 1243.15 | 955.03 | 0.188 | 0.247 | 0.077 |
18 | 44 | 1644.88 | 1585.08 | 0.209 | 0.287 | 0.087 |
19 | 26 | 2410.40 | 1353.10 | 0.182 | 0.268 | 0.092 |
20 | 43 | 2061.54 | 1437.38 | 0.172 | 0.275 | 0.098 |
Overall | 1579.29 | 1176.96 |