Table 1.
Sample | Species | Tortoise | Turtle | Clinical signs | Chlamydia PCR | Mycoplasma PCR | Gram positive isolates* | Gram negative isolates § | Candida spp. | ||||||||||||||||||||
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A | B | C | D | E | F | G | H | I | J | K | L | M | N | O | P | Q | R | S | T | U | V | ||||||||
1 | T. graeca | X | None | + | + | ||||||||||||||||||||||||
10 | T. graeca | X | Conjunctivitis | + | + | + | |||||||||||||||||||||||
11 | T. hosfieldi | X | Conjunctivitis | + | + | ||||||||||||||||||||||||
13 | T. graeca | X | None | + | + | ||||||||||||||||||||||||
14 | T. hermanni | X | Conjunctivitis | + | + | ||||||||||||||||||||||||
15 | T. graeca | X | None | + | + | + | |||||||||||||||||||||||
16 | T. graeca | X | None | + | + | + | |||||||||||||||||||||||
17 | T. graeca | X | None | + | + | ||||||||||||||||||||||||
18 | T. graeca | X | Weakeness | + | + | + | + | ||||||||||||||||||||||
19 | T. hermanni | X | None | + | + | + | |||||||||||||||||||||||
20 | T. hermanni | X | None | + | + | + | + | ||||||||||||||||||||||
21 | T. hermanni | X | None | + | + | ||||||||||||||||||||||||
22 | T. hermanni | X | None | + | + | + | + | ||||||||||||||||||||||
24 | T. graeca | X | None | + | + | ||||||||||||||||||||||||
25 | T. marginata | X | None | + | + | ||||||||||||||||||||||||
26 | T. hermanni | X | None | + | + | ||||||||||||||||||||||||
33 | T. hermanni | X | None | + | + | ||||||||||||||||||||||||
34 | T. hermanni | X | None | + | |||||||||||||||||||||||||
2 | T. scripta | X | None | + | + | ||||||||||||||||||||||||
3 | T. scripta | X | None | + | |||||||||||||||||||||||||
4 | T. scripta | X | None | + | + | ||||||||||||||||||||||||
5 | P. subrufa | X | None | + | + | ||||||||||||||||||||||||
6 | E. subglobosa | X | None | + | + | + | |||||||||||||||||||||||
7 | T. scripta | X | None | + | |||||||||||||||||||||||||
8 | T. scripta | X | None | + | + | ||||||||||||||||||||||||
9 | T. scripta | X | None | + | + | ||||||||||||||||||||||||
12 | T. scripta | X | None | + | |||||||||||||||||||||||||
23 | T. scripta | X | Conjunctivitis | + | + | ||||||||||||||||||||||||
27 | T. scripta | X | None | + | + | ||||||||||||||||||||||||
28 | T. scripta | X | None | + | |||||||||||||||||||||||||
29 | T. scripta | X | None | + | |||||||||||||||||||||||||
30 | T. scripta | X | None | + | + | + | |||||||||||||||||||||||
31 | T. scripta | X | None | + | |||||||||||||||||||||||||
32 | Pseudemys spp. | X | None | + |
*Gram positive isolates: A=Bacillus spp.; B=Kocuria varians/rosea; C=Staphylococcus aureus; D=Staphylococcus auricularis; E=Staphylococcus haemolyticus; F=Staphylococcus lentus; G=Staphylococcus sciuri; H=Staphylococcus xylosus.
§Gram negative isolates: I=Aeromonas hydrophila/caviae; J=Citrobacter freundii; K=Enterobacter cloacae; L=Morganella morganii; M=Ochrobactrum anthropic; N=Pasteurella multocida; O=Pasteurella pneumotropica/ haemolytica; P=Proteus spp.; Q=Pseudomonas luteola; R=Pseudomonas putida; S=Salmonella enterica ssp. arizonae; T=Sphingomonas paucimobilis; U=Stenotrophomonas maltophilia; V=Vibrio parahaemolyticus.