Table 2. Residues forming hydrogen bonds with the bound peptides.
A. baumannii DnaK | E. coli DnaK | hHsp70 | |||||||||||||
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Api88 | droso | helio | onco | pyrr | Api88 | droso | helio | onco | pyrr | Api88 | droso | helio | onco | pyrr | |
β1—L1,2 - β2 | - | - | E402 | - | - | - | E402 | E402 | - | - | - | E402 | - | - | - |
- | - | - | - | - | - | T403 | - | - | - | - | - | T403 | - | T403 | |
M404 | M404 | M404 | M404 | M404 | M404 | - | M404 | M404 | M404 | A404 | A404 | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G405 | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G406 | - | - | - | - | |
T409 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | T409 | - | - | |
β3—L3,4 - β4 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | Q424 | - | - | - | - |
- | V425 | V425 | - | - | - | V425 | - | - | - | T425 | T425 | - | - | - | |
S427 | S427 | S427 | S427 | S427 | S427 | S427 | S427 | S427 | S427 | T427 | T427 | T427 | T427 | T427 | |
A429 | - | A429 | A429 | A429 | A429 | A429 | - | A429 | A429 | - | Y429 | - | - | Y429 | |
- | - | - | - | - | - | E430 | E430 | E430 | - | - | - | - | S430 | - | |
Q433 | Q433 | Q433 | Q433 | Q433 | Q433 | Q433 | Q433 | Q433 | Q433 | - | - | - | - | Q433 | |
- | D437 | D437 | D437 | D437 | T437 | T437 | - | T437 | T437 | - | - | - | - | L437 | |
HB | - | - | - | - | - | D530 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
- | - | - | - | - | - | Q534 | - | Q534 | Q534 | - | - | - | - | - | |
- | N537 | - | N537 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | E538 | - | Q538 | - | Q538 | Q538 | Q538 | - | N538 | N538 | N538 | - | |
- | D540 | D540 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | H541 | - | - | E541 | - | - | |
S544 | - | - | S544 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | D580 | D580 | - | - | |
- | - | - | - | Q600 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Residues involved in interactions conserved in DnaK proteins and not in Hsp70 proteins are underlined.