Table 1.

Sequences of oligonucleotides used in this study

Bn-FAE1 promoter walking

FAES1: 5′ GTACTTGGACCGTCTACGATCTCC 3′

FAES2: 5′ GACGATCGCCGTTAACGGAAAGAAG 3′

S1LX3: 5′ GCAGTGCCGTCTCTTGGCCATGGC 3′

S1LX4: 5′ GCTACCTTGGCATTTGCCATGGGTCC 3′

FAED1: 5′ GCAGTGTTCCCAAGGACTATTTGTT 3′

FAED2: 5′ GTTGGTTATGACGTAATGGTAAAGG 3′

BnLH1.1: 5′ GTGGAGATAACTTCCCAACTATTTAC 3′

BnLH1.2: 5′ CTTGTAAGCTTTAGCCTTTGAGCT 3′

Gene specific RT-PCR

CE71: 5′ CTATTTTGCTCTCCAACAAGCCTG 3′

CE72: 5′ CTAGCACATCAATGACGGCTC 3′

CE81: 5′ GACGATGAGAACGGCAAAAC 3′

CE82: 5′ CTACATCGATCGGTGCTAGGC 3′

RNA quantitation control

RPL25: 5′ GTGATCGTGGTGTCCTCGCTAGAGC 3′

RPL23: 5′ GTCTGCCTTGGCAGCTGAAGCAGC 3′

Primer extension analysis

FAE17: 5′ GTGAAGATCGTCTATGGTAAGCCG 3′

FAE18: 5′ GTGGTGAAGATCGTCTATGGTAAG 3′

Promoter deletions

FAE11F3: 5′ TAACGCCTAATGGTCACCG 3′

FAE11F4: 5′ GACCTATGGACCCATGGC 3′

FAE11F5: 5′ TAGCCTATCACTGCTAAGTAC 3′

FAE11F6: 5′ AGACAGAAATCTAGACTC 3′

FAE11F7: 5′ GCACCTTTCATCGGACTACTG 3′

FAE11F8: 5′ ACGGACCACAAAAGAGGATCC 3′

FAE11R: 5′ ACGGACGTCATGACTCAGTGTGTG 3′

PCR test for nptll/GUS transgenics

Nptll

TN5FOR: 5′ CGCAGGTTCTCCGGCCGCTTGGGTGG 3′

TN5REV: 5′ AGCAGCCAGTCCCTTCCCGCTTCAG 3′

Internal control

RES FOR: 5′ GGTCAGGTTGCCTAGGAAGC 3′

RES REV: 5′ CGAGTGACACTTGATGTGAACATGC 5′

GUS

GUS2FOR: 5′ TGACGCATGTCGCGCCAAGAC 3′

GUS2REV: 5′ ATCCTTTGCCACGTAAGTCC 3′