Table 2.
Characterization of endogenous vaginal and rectal Lactobacillus isolates recovered from Chinese rhesus macaques
| Animal | Isolate | Origin of isolation |
Lactobacillus species1 |
Carbohydrate fermentation by API 50 CH tests2 | H2O23 production |
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|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LARA | RIB | GAL | GLU | FRU | MNE | DUL | MAN | SOR | MDG | NAG | AMY | ARB | ESC | SAL | CEL | MAL | LAC | MEL | SAC | TRE | RAF | AMD | GEN | TUR | TAG | |||||
| ABL-1 | ABL-V1 | Vagina | L. johnsonii | − | ||||||||||||||||||||||||||
| ABL-2 | ABL-V2 | Vagina | L. johnsonii | +++ | ||||||||||||||||||||||||||
| ABL-3 | ABL-V3 | Vagina | L. johnsonii | +++ | ||||||||||||||||||||||||||
| ABL-4 | ABL-V4 | Vagina | L. johnsonii | − | ||||||||||||||||||||||||||
| ABL-6 | ABL-V6A | Vagina | L. johnsonii | − | ||||||||||||||||||||||||||
| ABL-R6A | Rectum | L. johnsonii | − | |||||||||||||||||||||||||||
| ABL-R6B | Rectum | L. johnsonii | +++ | |||||||||||||||||||||||||||
| ABL-V6B | Vagina | L. murinus | − | |||||||||||||||||||||||||||
| ABL-R6C | Rectum | L. murinus | − | |||||||||||||||||||||||||||
| ABL-7 | ABL-V7A | Vagina | L. johnsonii | +++ | ||||||||||||||||||||||||||
| ABL-R7A | Rectum | L. johnsonii | − | |||||||||||||||||||||||||||
| ABL-V7B | Vagina | L. acidophilus | − | |||||||||||||||||||||||||||
| ABL-R7B | Rectum | L. acidophilus | +++ | |||||||||||||||||||||||||||
| ABL-V7C | Vagina | L. amylovorous | +++ | |||||||||||||||||||||||||||
| ABL-8 | ABL-V8A | Vagina | L. johnsonii | +++ | ||||||||||||||||||||||||||
| ABL-R8A | Rectum | L. johnsonii | − | |||||||||||||||||||||||||||
| ABL-V8B | Vagina | L. amylovorous | − | |||||||||||||||||||||||||||
| SRI-1 | SRI-V1 | Vagina | L. johnsonii | +++ | ||||||||||||||||||||||||||
| SRI-R1 | Rectum | L. johnsonii | +++ | |||||||||||||||||||||||||||
| SRI-2 | SRI-V2 | Vagina | L. johnsonii | − | ||||||||||||||||||||||||||
| SRI-3 | SRI-V3A | Vagina | L. johnsonii | +++ | ||||||||||||||||||||||||||
| SRI-V3B | Vagina | L. johnsonii | +++ | |||||||||||||||||||||||||||
| SRI-R3 | Rectum | L. johnsonii | +++ | |||||||||||||||||||||||||||
| SRI-4 | SRI-V4 | Vagina | L. johnsonii | +++ | ||||||||||||||||||||||||||
| SRI-R4 | Rectum | L. johnsonii | +++ | |||||||||||||||||||||||||||
| SRI-5 | SRI-V5 | Vagina | L. johnsonii | +++ | ||||||||||||||||||||||||||
| SRI-R5 | Rectum | L. johnsonii | +++ | |||||||||||||||||||||||||||
Species of Lactobacillus isolates was determined by 16S rRNA gene sequencing as described in Materials and Methods.
White box: positive fermentation; grey box: negative fermentation. LARA, L-arabinose; RIB, D-ribose; GAL, D-galactose; GLU, D-glucose; FRU, D-fructose; MNE, D-mannose; DUL, dulcitol; MAN, D-mannitol; SOR, D-sorbitol; MDG, methyl-αD-glucopyranoside; NAG, N-acetylglucosamine; AMY, amygdalin; ARB, arbutin; ESC, esculin ferric citrate; SAL, salicin; CEL, D-cellobiose; MAL, D-maltose; LAC, D-lactose; MEL, D-melibiose; SAC, D-saccharose; TRE, D-trehalose; RAF, D-raffinose; AMD, amidon (starch); GEN, gentiobiose; TUR, D-turanose; TAG, D-tagatose.
+++: strong H2O2 production; −: no H2O2 production in 30 min.