Table 2.
Gene methylation patterns above the optimal cut-off value for individual lesions in breast cancer progression.
| APC* | CDH1* | CTNN1B* | |
|---|---|---|---|
| BP1 IDC | M | M | M |
| BP2 IDC | M | M | M |
| BP5 IDC | M | M | M |
| BP8 IDC | M | M | M |
| BP15 IDC | M | M | M |
| B22A DCIS | M | M | um |
| BP13 IDC | M | M | um |
| BP21 IDC | M | M | um |
| B22 IDC | M | M | um |
| BP31 IDC | M | M | um |
| BP32 IDC | M | M | um |
| BP33 IDC | M | M | um |
| BP34 IDC | M | M | um |
| BP35 DCIS | M | M | um |
| BP13 ADH | M | M | um |
| BP6 ADH | M | M | um |
| BP18-9A DCIS | M | M | um |
| BP3 DCIS | M | M | um |
| B22B DCIS | M | M | um |
| BP23 DCIS | M | M | um |
| BP18-72 IDC | M | um | M |
| BP9 IDC | M | um | M |
| BP12 IDC | M | um | M |
| BP18-9B DCIS | M | um | M |
| B25 DCIS | M | um | M |
| BP31 DCIS | M | um | M |
| BP9 ADH | M | um | M |
| BP10 IDC | um | M | M |
| BP3 ADH | um | M | M |
| BP4 ADH | um | M | M |
| BN10 NBT | um | M | M |
| BP6 IDC | um | M | um |
| BP14 IDC | um | M | um |
| BP36 IDC | um | M | um |
| BP37 IDC | um | M | um |
| BP11 IDC | um | M | um |
| BP14 DCIS | um | M | um |
| BP21 DCIS | um | M | um |
| BP2 ADH | um | M | um |
| BP10 ADH | um | M | um |
| BP4 IDC | um | um | M |
| BP7 IDC | um | um | M |
| BP5 ADH | um | um | M |
| BP38 IDC | M | um | um |
| BP39 IDC | M | um | um |
| BP40 IDC | M | um | um |
| BP41 IDC | M | um | um |
| BP42 IDC | M | um | um |
| BP43 IDC | M | um | um |
| BP44 IDC | M | um | um |
| BP45 IDC | M | um | um |
| BP17 IDC | M | um | um |
| BP18-6 IDC | M | um | um |
| BP29 IDC | M | um | um |
| BP30 IDC | M | um | um |
| BP39 DCIS | M | um | um |
| BP9 DCIS | M | um | um |
| BP12 DCIS | M | um | um |
| BP15 DCIS | M | um | um |
| BP17 DCIS | M | um | um |
| BP18-6 DCIS | M | um | um |
| BP26 DCIS | M | um | um |
| BP27 DCIS | M | um | um |
| BP28 DCIS | M | um | um |
| BP29 DCIS | M | um | um |
| BP39 ADH | M | um | um |
| BP23A ADH | M | um | um |
| BP23B ADH | M | um | um |
| BP27 ADH | M | um | um |
| BP31 ADH | M | um | um |
| BP8 ADH | M | um | um |
| BP16 ADH | M | um | um |
| BN1 NBT | M | um | um |
| BN15 NBT | M | um | um |
| BP19 IDC | um | um | um |
| BP24 IDC | um | um | um |
| BP46 IDC | um | um | um |
| BP47 IDC | um | um | um |
| BP48 IDC | um | um | um |
| BP49 IDC | um | um | um |
| BP50 IDC | um | um | um |
| BP51 IDC | um | um | um |
| BP52 IDC | um | um | um |
| BP38 DCIS | um | um | um |
| BP47 DCIS | um | um | um |
| BP53 DCIS | um | um | um |
| BP54 DCIS | um | um | um |
| BP55 DCIS | um | um | um |
| BP53 ADH | um | um | um |
| BP46 ADH | um | um | um |
| BP10 DCIS | um | um | um |
| BP13 DCIS | um | um | um |
| BP19 DCIS | um | um | um |
| B24 DCIS | um | um | um |
| BP30 DCIS | um | um | um |
| BP20 DCIS | um | um | um |
| BP1 ADH | um | um | um |
| BP7 ADH | um | um | um |
| BP11 ADH | um | um | um |
| BN2 NBT | um | um | um |
| BN3 NBT | um | um | um |
| BN4 NBT | um | um | um |
| BN5 NBT | um | um | um |
| BN6 NBT | um | um | um |
| BN7 NBT | um | um | um |
| BN8 NBT | um | um | um |
| BN9 NBT | um | um | um |
| BN11 NBT | um | um | um |
| BN12 NBT | um | um | um |
| BN13 NBT | um | um | um |
| BN14 NBT | um | um | um |
| BN16 NBT | um | um | um |
| BN17 NBT | um | um | um |
| BN18 NBT | um | um | um |
| BN19 NBT | um | um | um |
| BN20 NBT | um | um | um |
*
M, methylated sample; um, unmethylated sample.