Table 1. Atom types in 3dRNAscore potential.
A | P OP1 OP2 O5′ C5′ C4′ O4′ C3′ O3′ C2′ O2′ C1′ |
N9 C8 N7 C5 C6 N6 N1 C2 N3 C4 | |
U | P OP1 OP2 O5′ C5′ C4′ O4′ C3′ O3′ C2′ O2′ C1′ |
N1 C2 O2 N3 C4 O4 C5 C6 | |
C | P OP1 OP2 O5′ C5′ C4′ O4′ C3′ O3′ C2′ O2′ C1′ |
N1 C2 O2 N3 C4 N4 C5 C6 | |
G | P OP1 OP2 O5′ C5′ C4′ O4′ C3′ O3′ C2′ O2′ C1′ |
N9 C8 N7 C5 C6 O6 N1 C2 N2 N3 C4 |