Table 2.
#CHROM POS | GENE(S) | Effect | Codon | AA | REF | ALT | GSY4318 | GSY4322 | GSY4319 | GSY4323 | GSY4321 | GSY4324 | |
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chrII | 371865 | TIP1 | DOWNSTREAM | T | A | ||||||||
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chrIV | 329069 | YDL073W | SYNONYMOUS | ctG/ctC | L/A | G | C | ||||||
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chrV | 143645 | MIT1 | NON_SYNONYMOUS | YEL007W:c.1754T>G, YEL007W:p.Met585Arg | T | G | |||||||
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chrV | 143646^143647 | MIT1 | FRAMESHIFT | YEL007W:c.1755_1756insG, YEL007W:p.Tyr586fs | - | G | |||||||
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chrXI | 524880 | PET10 | NON_SYNONYMOUS | agC/agA | S/R | G | T | ||||||
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chrXIII | 859932 | LCB1 | NON_SYNONYMOUS | gaC/gaA | D/E | G | T | ||||||
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chrXV | 988368 | PUT4 | NON_SYNONYMOUS | Tgc/Cgc | C/R | A | G | ||||||
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chrII | 600545 | PCH2 | UPSTREAM | A | G | ||||||||
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chrVI | 108690 | IES1 | NON_SYNONYMOUS | gAg/gGg | E/G | T | C | ||||||
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chrXIII | 420692 | tV(AAC)M2 | UPSTREAM | A | G | ||||||||
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chrXI | 313785 | tH(GUG)K | UPSTREAM | C | T | ||||||||
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chrXII | 770185 | BUD6 | NON_SYNONYMOUS | aaC/aaA | N/K | G | T | ||||||
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chrXIV | 368081 | SRV2 | NON_SYNONYMOUS | ttT/ttA | F/L | T | A | ||||||
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chrIV | 1462683 | GIN4 | STOP_GAINED | tCa/tGa | S/* | G | C | ||||||
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chrX | 179937 | PBS2 | NON_SYNONYMOUS | gCt/gGt | A/G | G | C | ||||||
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chrMito | 57268 | INTERGENIC | T | A | |||||||||
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chrXII | 405042 | ACE2 | NON_SYNONYMOUS | tAc/tCc | Y/S | T | G | ||||||
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chrII | 85054 | SSA3 | SYNONYMOUS | gcT/gcG | A/A | A | C | ||||||
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chrX | 237313 | LSB6 | NON_SYNONYMOUS | aaG/aaC | K/N | G | C | ||||||
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chrX | 364859 | MHP1 | NON_SYNONYMOUS | gCa/gTa | A/V | C | T | ||||||
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chrXIV | 144125 | IST1, PIK1 | DOWNSTREAM | C | G | ||||||||
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chrXVI | 926957 | OPT2 | UPSTREAM | G | T | ||||||||
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chrVII | 44172 | TAD1 | NON_SYNONYMOUS | cCa/cGa | P/R | C | G | ||||||
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chrXV | 902077 | SPS4 | NON_SYNONYMOUS | atT/atG | I/M | A | C | ||||||
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chrV | 476850 | BEM2 | NON_SYNONYMOUS | gGa/gCa | G/A | C | G | ||||||
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chrVIII | 197604 | INM1 | NON_SYNONYMOUS | Tat/Cat | Y/H | A | G | ||||||
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chrXII | 953417 | PUN1 | NON_SYNONYMOUS | aGc/aAc | S/N | C | T | ||||||
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chrXIV | 736085 | BIO3 | DOWNSTREAM | C | T | ||||||||
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