Table 3.
#CHROM | POS | GENE(S) | Effect | Codon | AA | REF | ALT | GSY2750 | GSY2754 | GSY2756 | GSY2751 | GSY2755 | GSY2757 | GSY2753 |
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chrII | 371865 | TIP1 | DOWNSTREAM | T | A | |||||||||
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chrI | 128481 | SYN8 | FRAMESHIFT | S/Frameshift | G | - | ||||||||
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chrV | 364256 | SSA4 | UPSTREAM | A | G | |||||||||
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chrVIII | 519892 | CRG1 | SYNONYMOUS | ccC/ccT | P/P | C | T | |||||||
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chrXV | 178574 | IRA2 | NON_SYNONYMOUS | aCa/aAa | T/K | C | A | |||||||
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chrMito | 80513 | COX3 | DOWNSTREAM | C | G | |||||||||
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chrIV | 1289911 | SIZ1 | NON_SYNONYMOUS | tCt/tAt | S/Y | C | A | |||||||
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chrX | 666710 | STR2 | NON_SYNONYMOUS | tCt/tTt | S/F | G | A | |||||||
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chrXII | 147914 | DNM1 | NON_SYNONYMOUS | Cct/Act | P/T | C | A | |||||||
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chrXV | 606620 | MDM32 | NON_SYNONYMOUS | cGt/cCt | R/P | G | C | |||||||
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chrIV | 67810 | TIM22, YDL218W | DOWNSTREAM | C | A | |||||||||
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chrIV | 183707 | RPC53 | NON_SYNONYMOUS_CODING | tCt/tTt | S/F | C | T | |||||||
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chrVIII | 167568 | YHR028W-A | NON_SYNONYMOUS | YHR028W-A:c.217T>G,218C>G,219C>A | TCC | GGA | ||||||||
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chrX | 304208 | JEM1 | NON_SYNONYMOUS | tCg/tGg | S/W | C | G | |||||||
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chrXI | 158736 | RPS27A | INTRON | A | G | |||||||||
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chrXI | 647912 | FLO10 | SYNONYMOUS | tcT/tcA | S | T | A | |||||||
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chrXVI | 416459 | YTA6 | NON_SYNONYMOUS | Caa/Aaa | Q/K | C | A | |||||||
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chrII | 452501 | PHO88 | UPSTREAM | G | T | |||||||||
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chrXV | 557840 | UBP2 | NON_SYNONYMOUS | aGa/aCa | R/T | C | G | |||||||
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chrIII | 283793 | CDC39 | NON_SYNONYMOUS | tAt/tGt | Y/C | A | G | |||||||
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chrVII | 321148 | INTERGENIC | T | C | ||||||||||
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chrVIII | 524447 | INTERGENIC | C | G | ||||||||||
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chrIV | 675571 | YDR109C | NON_SYNONYMOUS | Caa/Aaa | Q/K | G | T | |||||||
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chrIV | 785856 | TRM82 | NON_SYNONYMOUS | aCa/aTa | T/I | C | T | |||||||
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chrVIII | 418602 | TDA11 | STOP_GAINED | Gag/Tag | E/* | G | T | |||||||
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chrIX | 89756 | TMA108, TPM2 | INTERGENIC | G | C | |||||||||
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chrXII | 838026 | ILV5 | DOWNSTREAM | C | A | |||||||||
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chrXV | 179275 | IRA2 | STOP_GAINED | Gag/Tag | E/* | G | T | |||||||
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chrXVI | 95218 | CIN2, IQG1 | INTERGENIC | G | A | |||||||||
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chrXVI | 421772 | MUK1 | STOP_GAINED | taC/taA | Y/* | C | A | |||||||
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chrV | 143507 | MIT1 | NON_SYNONYMOUS | gAa/gCa | E/A | A | C | |||||||
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chrXII | 921722 | BDF1, YLR400W | UPSTREAM | C | G | |||||||||
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chrXV | 213387 | PRS5 | NON_SYNONYMOUS | Acc/Gcc | T/A | A | G | |||||||
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chrIX | 69868 | SLN1 | NON_SYNONYMOUS | Cca/Gca | P/A | G | C | |||||||
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chrXIV | 119311 | BOR1 | NON_SYNONYMOUS | aCa/aGa | T/R | C | G | |||||||
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chrXVI | 898617 | SEC23 | NON_SYNONYMOUS | Gat/Cat | D/H | C | G | |||||||
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chrMito | 10368 | INTERGENIC | T | C | ||||||||||
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chrMito | 84816 | RPM1, tM(CAU)Q2 | UPSTREAM | A | T | |||||||||
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