Skip to main content
. 2015 Jun 9;10(6):e0127979. doi: 10.1371/journal.pone.0127979

Table 2. Average genetic diversity of 10 nuclear loci within 18 swordfish populations.

    Locus
Population   ARP ALDB GpHR Act2α ATPsβ CaM Mlc2 SRP54 LDHA ANT
1 A 2 4 5 2 2 2 3 2 3 5
H o 0.288 0.288 0.615 0.231 0.500 0.346 0.173 0.327 0.385 0.442
H E 0.447 0.287 0.581 0.473 0.453 0.497 0.206 0.322 0.450 0.567
F IS 0.354 -0.005 -0.059 0.513 -0.105 0.304 0.161 -0.014 0.145 0.220
2 A 2 4 5 2 2 2 3 2 3 5
H o 0.347 0.224 0.571 0.592 0.469 0.510 0.265 0.388 0.633 0.571
H E 0.479 0.205 0.512 0.500 0.493 0.497 0.320 0.359 0.468 0.522
F IS 0.276 -0.097 -0.115 -0.184 0.047 -0.027 0.170 -0.079 -0.352 -0.094
3 A 2 4 5 2 2 2 3 2 3 5
Ho 0.381 0.238 0.571 0.429 0.429 0.476 0.357 0.310 0.476 0.405
HE 0.472 0.218 0.521 0.459 0.427 0.499 0.381 0.262 0.447 0.504
FIS 0.192 -0.094 -0.097 0.067 -0.003 0.045 0.062 -0.183 -0.065 0.197
4 A 2 4 5 2 2 2 3 2 3 6
H o 0.417 0.188 0.521 0.458 0.458 0.500 0.458 0.292 0.583 0.542
H E 0.444 0.209 0.513 0.413 0.457 0.499 0.400 0.330 0.476 0.545
F IS 0.062 0.101 -0.015 -0.109 -0.002 -0.002 -0.147 0.116 -0.225 0.007
5 A 2 3 4 2 2 2 2 2 2 5
H o 0.471 0.176 0.353 0.353 0.412 0.471 0.353 0.235 0.588 0.412
H E 0.415 0.164 0.424 0.415 0.389 0.498 0.291 0.291 0.457 0.356
F IS -0.133 -0.074 0.167 0.150 -0.058 0.056 -0.214 0.190 -0.288 -0.155
6 A 2 3 3 2 2 2 2 2 3 4
H o 0.350 0.150 0.300 0.200 0.350 0.400 0.350 0.250 0.700 0.500
H E 0.489 0.141 0.339 0.255 0.349 0.480 0.349 0.219 0.540 0.529
F IS 0.284 -0.062 0.114 0.216 -0.004 0.167 -0.004 -0.143 -0.296 0.054
7 A 2 3 3 2 2 2 2 2 3 4
H o 0.350 0.150 0.300 0.200 0.350 0.400 0.350 0.250 0.700 0.500
H E 0.489 0.141 0.339 0.255 0.349 0.480 0.349 0.219 0.540 0.529
F IS 0.284 -0.062 0.114 0.216 -0.004 0.167 -0.004 -0.143 -0.296 0.054
8 A 2 4 5 2 2 2 3 2 3 5
H o 0.301 0.301 0.590 0.349 0.422 0.470 0.494 0.108 0.494 0.518
H E 0.384 0.294 0.503 0.319 0.451 0.497 0.506 0.164 0.511 0.532
F IS 0.215 -0.024 -0.173 -0.097 0.065 0.055 0.023 0.340 0.034 0.026
9 A 2 2 4 2 2 2 2 2 3 3
H o 0.339 0.390 0.525 0.356 0.475 0.424 0.559 0.051 0.424 0.627
H E 0.324 0.403 0.505 0.314 0.493 0.479 0.500 0.050 0.514 0.539
F IS -0.046 0.032 -0.041 -0.134 0.037 0.116 -0.119 -0.026 0.176 -0.163
10 A 2 4 5 2 2 2 3 2 3 4
H o 0.400 0.200 0.400 0.300 0.600 0.350 0.200 0.200 0.400 0.400
H E 0.480 0.186 0.505 0.375 0.495 0.439 0.395 0.180 0.499 0.468
F IS 0.167 -0.074 0.208 0.200 -0.212 0.202 0.494 -0.111 0.198 0.144
11 A 2 4 5 2 2 2 3 2 3 6
H o 0.432 0.108 0.568 0.216 0.541 0.459 0.297 0.297 0.486 0.622
H E 0.456 0.104 0.581 0.307 0.482 0.407 0.360 0.290 0.481 0.555
F IS 0.051 -0.039 0.024 0.295 -0.121 -0.130 0.174 -0.026 -0.011 -0.120
12 A 2 6 5 2 2 2 3 2 3 6
H o 0.536 0.232 0.500 0.554 0.375 0.232 0.411 0.268 0.536 0.464
H E 0.497 0.213 0.464 0.481 0.500 0.205 0.406 0.305 0.526 0.439
F IS -0.077 -0.090 -0.078 -0.152 0.250 -0.131 -0.012 0.121 -0.018 -0.057
13 A 2 3 5 2 2 2 3 2 3 5
H o 0.405 0.262 0.524 0.452 0.429 0.190 0.286 0.452 0.429 0.476
H E 0.477 0.234 0.535 0.350 0.459 0.172 0.338 0.350 0.489 0.458
F IS 0.152 -0.117 0.021 -0.292 0.067 -0.105 0.154 -0.292 0.123 -0.040
14 A 2 5 5 2 2 2 3 2 3 6
H o 0.511 0.222 0.556 0.422 0.489 0.156 0.400 0.333 0.533 0.600
H E 0.475 0.206 0.573 0.437 0.429 0.143 0.336 0.278 0.529 0.552
F IS -0.075 -0.080 0.030 0.033 -0.141 -0.084 -0.190 -0.200 -0.009 -0.088
15 A 2 3 5 2 2 2 2 2 3 5
H o 0.571 0.393 0.393 0.286 0.643 0.179 0.250 0.357 0.571 0.321
H E 0.500 0.327 0.596 0.337 0.459 0.163 0.270 0.337 0.548 0.524
F IS -0.143 -0.201 0.341 0.152 -0.400 -0.098 0.073 -0.061 -0.043 0.387
16 A 2 3 5 2 2 2 3 2 3 4
H o 0.514 0.257 0.429 0.486 0.543 0.200 0.571 0.457 0.629 0.514
H E 0.467 0.232 0.487 0.420 0.441 0.180 0.454 0.382 0.551 0.449
F IS -0.101 -0.107 0.121 -0.156 -0.230 -0.111 -0.258 -0.197 -0.140 -0.144
17 A 2 6 5 2 2 2 3 2 3 4
H o 0.409 0.364 0.545 0.318 0.432 0.114 0.341 0.386 0.500 0.568
H E 0.474 0.339 0.549 0.397 0.456 0.146 0.334 0.407 0.468 0.493
F IS 0.137 -0.073 0.006 0.198 0.054 0.224 -0.022 0.050 -0.069 -0.154
18 A 2 4 5 2 2 2 3 2 3 5
H o 0.457 0.152 0.457 0.304 0.435 0.217 0.326 0.348 0.565 0.543
H E 0.471 0.182 0.473 0.364 0.440 0.194 0.368 0.315 0.512 0.534
  F IS 0.032 0.165 0.034 0.164 0.011 -0.122 0.115 -0.105 -0.104 -0.018

A: The number of alleles; H 0: observed heterozygosity; H E: expected heterozygositiy; F IS: inbreeding cooeffcient