Table 2. Mutations registered in the cytochrome b gene of the Tunisian clones.
Nucleotide | 30 | 61 | 138 | 342 | 385 | 417 | 427–429 | 436 | 445 | 593 | 655 | 757 | 785 | 849 | 870 | 1040 | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Codon | 10 | 21* | 46 | 114* | 129* | 139 | 143 | 146* | 149 | 198* | 219* | 253* | 262* | 283 | 290 | 347* | |
Tancytb (XM949625) | TCG | TGG | GTG | ATA | AGC | TTA | TTC | GCT | CTA | ATA | GTT | CCT | TTA | GCA | GTA | TCA | |
Sensitive clones | BattanC1 | … | … | ..A | … | … | ..G | ..T | A.. | … | G.. | A.. | … | … | … | ..G | … |
BattanC2 | … | … | ..A | … | … | ..G | ..T | A.. | .. | G.. | A.. | … | .. | … | ..G | … | |
BattanC3 | … | … | ..A | … | … | ..G | ..T | A.. | … | G.. | A.. | … | … | … | ..G | … | |
BattanC4 | … | … | ..A | … | … | ..G | ..T | A.. | … | G.. | A.. | … | … | … | ..G | … | |
BattanC5 | … | … | ..A | … | … | ..G | ..T | A.. | … | G.. | A.. | … | … | … | ..G | … | |
BejaC2 | … | … | ..A | … | … | ..G | ..T | A.. | … | … | A.. | … | … | ..G | ..G | … | |
BejaC3 | … | … | ..A | … | … | ..G | ..T | A.. | … | … | A.. | … | … | ..G | ..G | … | |
Jed4C2 | … | C.. | ..A | … | … | ..G | * C.T | A.. | T.. | … | A.. | … | … | … | ..G | … | |
SousseC2 | … | … | ..A | … | … | ..G | ..T | A.. | … | … | A.. | … | … | ..G | ..G | … | |
Resistant clones | ST2/12C3 | … | … | ..A | … | … | ..G | ..T | A.. | … | … | A.. | T.. | … | … | ..G | … |
ST2/12C4 | ..A | … | ..A | … | … | ..G | ..T | A.. | … | … | A.. | … | … | … | ..G | .T. | |
ST2/12C5 | … | … | ..A | ..G | … | ..G | ..T | A.. | … | … | A.. | … | … | … | ..G | … | |
ST2/12C6 | … | … | ..A | … | G.. | ..G | ..T | A.. | … | … | A.. | … | … | … | ..G | … | |
ST2/13C2 | … | … | ..A | … | … | ..G | ..T | A.. | … | … | A.. | … | .C. | … | ..G | … | |
ST2/13C6 | ..A | … | ..A | … | … | ..G | ..T | A.. | … | … | A.. | … | … | … | ..G | .T. | |
ST2/13C7 | … | … | ..A | … | … | ..G | ..T | A.. | … | … | A.. | … | .C. | … | ..G | … | |
ST2/13C13 | … | … | ..A | … | G.. | ..G | ..T | A.. | … | … | A.. | … | … | ..G | ..G | … | |
ST2/19C1 | … | … | ..A | … | … | ..G | ..T | A.. | … | … | A.. | … | .C. | … | ..G | … | |
ST2/19C3 | ..A | … | ..A | … | … | ..G | ..T | A.. | … | … | A.. | … | … | … | ..G | .T. | |
ST2/19C4 | … | … | ..A | … | … | ..G | ..T | A.. | … | … | A.. | … | .C. | … | ..G | … | |
ST2/19C5 | … | … | ..A | … | … | ..G | ..T | A.. | … | … | A.. | … | .C. | … | ..G | … | |
ST2/19C6 | … | … | ..A | … | … | ..G | ..T | A.. | … | … | A.. | … | .C. | … | ..G | … | |
ST2/19C10 | … | … | ..A | … | … | ..G | ..T | A.. | … | … | A.. | T.. | .C. | … | ..G | … | |
ST2/19C11 | … | … | ..A | … | … | ..G | ..T | A.. | … | … | A.. | … | .C. | … | ..G | … | |
ST2/19C13 | … | … | ..A | … | … | ..G | ..T | A.. | … | … | A.. | … | .C. | … | ..G | … | |
ST2/19C16 | … | … | ..A | … | … | ..G | ..T | A.. | … | … | A.. | T.. | … | … | ..G | … | |
ST2/19C18 | … | … | ..A | … | … | ..G | ..T | A.. | … | … | A.. | … | .C. | … | ..G | … | |
ST2/19C19 | … | … | ..A | … | … | ..G | ..T | A.. | … | … | A.. | … | .C. | … | ..G | … |
*: Nonsynonymous mutation