TABLE 1.
Bacterial strains and the specificity of primers for the detection of bacteria by PCR
| Species | Strain | Specificity of primer pair for detection of bacteria
|
||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| UniF, LactoR | LactoF, LactoR | LcaseF, LcaseR | LrhamF, LcaseR | LfermF, LactoR | LactoF, LgassR | LsaliF, LactoR | LcrisF, LcrisR | LgallF, LcrisR | LdelbF, LdelbR | LultF, LcrisR | ||
| Lactobacillus casei subsp. casei | ATCC 393 | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| Lactobacillus paracasei subsp. paracasei | ATCC 25302 | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − |
| Lactobacillus rhamnosus | ATCC 7469 | + | + | − | + | − | − | − | − | − | − | − |
| Lactobacillus rhamnosus | CCUG 27772 | + | + | − | + | − | − | − | − | − | − | − |
| Lactobacillus fermentum | ATCC 14931 | + | + | − | − | + | − | − | − | − | − | − |
| Lactobacillus fermentum | ATCC 9338 | + | + | − | − | + | − | − | − | − | − | − |
| Lactobacillus gasseri | ATCC 33323 | + | + | − | − | − | + | − | − | − | − | − |
| Lactobacillus salivarius subsp. salivarius | ATCC 11741 | + | + | − | − | − | − | + | − | − | − | − |
| Lactobacillus salivarius subsp. salicinus | ATCC 11742 | + | + | − | − | − | − | + | − | − | − | − |
| Lactobacillus crispatus | ATCC 33820 | + | + | − | − | − | − | − | + | − | − | − |
| Lactobacillus gallinarum | ATCC 33199 | + | + | − | − | − | − | − | − | + | − | − |
| Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus | ATCC 11842 | + | + | − | − | − | − | − | − | − | + | − |
| Lactobacillus delbrueckii | ATCC 9649 | + | + | − | − | − | − | − | − | − | + | − |
| Lactobacillus acidophilus | ATCC 4356 | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| Lactobacillus brevis | ATCC 14869 | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| Lactobacillus reuteri | ATCC 23272 | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| Lactobacillus plantarum | ATCC 10241 | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| Lactobacillus plantarum | ATCC 14917 | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| Lactobacillus oris | NCFB 2160 | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| Lactobacillus oris | NCFB 2164 | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| Lactobacillus leichmanni | ATCC 4797 | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| Escherichia coli | XL-1 Blue | +/− | − | |||||||||
| Staphylococcus aureus | ATCC 12600 | + | − | |||||||||
| Pseudomonas aeruginosa | ATCC 19660 | − | − | |||||||||
| Haemophilus influenzae | MSHRIN-1 | − | − | |||||||||
| Streptococcus pyogenes | MSHRPY-1 | +/− | − | |||||||||
| Streptococcus pneumoniae | MSHRPN-1 | − | − | |||||||||
| Moraxella catarrhalis | MSHRCA-1 | − | − | |||||||||
| Porphyromonas gingivalis | ATCC 33277 | − | − | |||||||||
| Fusobacterium nucleatum | ATCC 25586 | +/− | − | |||||||||
| Peptostreptococcus micros | ATCC 33270 | +/− | − | |||||||||
| Serratia marcescens | ATCC 274 | − | − | |||||||||