Table 1.
GenoType | MALDI-TOF | Score | GenoType | MALDI-TOF | Score | Sequencing | ||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | M. avium | M. avium | 2.078 | 34 | M. fortuitum | M. fortuitum | 2.157 | |
2 | M. avium | M. avium | 1.657 | 35 | M. fortuitum | M. fortuitum | 1.877 | |
3 | M. avium | M. avium | 1.932 | 36 | M. fortuitum | M. porcinum | 2.222 | |
4 | M. avium | M. avium | 2.041 | 37 | M. chelonae | M. chelonae | 2.307 | |
5 | M. avium | M. avium | 1.626 | 38 | M. chelonae | M. chelonae | 1.667 | |
6 | M. avium | M. avium | 2.101 | 39 | M. chelonae | M. chelonae | 1.857 | |
7 | M. avium | M. avium | 2.100 | 40 | M. chelonae | M. chelonae | 2.064 | |
8 | M. avium | M. avium | 2.038 | 41 | M. chelonae | M. chelonae | 1.715 | |
9 | M. avium | M. avium | 2.009 | 42 | M. abscessus | M. abscessus | 2.107 | |
10 | M. avium | M. avium | 2.038 | 43 | M. abscessus | M. abscessus | 2.060 | |
11 | M. avium | M. avium | 1.858 | 44 | M. abscessus | M. abscessus | 2.320 | |
12 | M. avium | M. avium | 2.191 | 45 | M. abscessus | M. abscessus | 2.198 | |
13 | M. avium | M. avium | 2.100 | 46 | M. mucogenicum | M. phocaicum | 2.264 | |
14 | M. avium | M. avium | 2.180 | 47 | M. mucogenicum | M. phocaicum | 2.027 | |
15 | M. avium | M. avium | 2.003 | 48 | M. mucogenicum | M. phocaicum | 2.150 | |
16 | M. avium | M. avium | 2.009 | 49 | M. kansasii | M. kansasii | 1.600 | |
17 | M. intracellulare | M. intracellulare | 2.168 | 50 | M. kansasii | M. kansasii | 1.891 | |
18 | M. intracellulare | M. intracellulare | 2.217 | 51 | M. kansasii | M. kansasii | 2.199 | |
19 | M. intracellulare | M. intracellulare | 1.600 | 52 | M. kansasii | M. kansasii | 2.257 | |
20 | M. intracellulare | M. intracellulare | 2.005 | 53 | M. gordonae | M. gordonae | 1.914 | |
21 | M. intracellulare | M. intracellulare | 2.182 | 54 | M. gordonae | M. gordonae | 2.232 | |
22 | M. intracellulare | M. intracellulare | 2.148 | 55 | M. gordonae | M. gordonae | 2.096 | |
23 | M. intracellulare | M. intracellulare | 2.275 | 56 | M. gordonae | M. gordonae | 2.274 | |
24 | M. intracellulare | M. intracellulare | 2.272 | 57 | M. lentiflavum | M. lentiflavum | 2.171 | |
25 | M. intracellulare | M. intracellulare/Ch1 | 2.016 | 58 | M. lentiflavum | M. lentiflavum | 2.205 | |
26 | M. intracellulare | M. intracellulare | 2.369 | 59 | M. lentiflavum | M. lentiflavum | 2.278 | |
27 | M. intracellulare | M. intracellulare | 2.057 | 60 | M. scrofulaceum | M. scrofulaceum/para2 | 1.985 | |
28 | M. intracellulare | M. intracellulare/Ch1 | 1.730 | 61 | M. scrofulaceum | M. scrofulaceum/para2 | 1.900 | |
29 | M. intracellulare | M. intracellulare | 2.050 | 62 | M. peregrinum | M. peregrinum | 2.056 | |
30 | M. fortuitum | M. fortuitum | 2.376 | 63 | M. marinum | M. marinum | 2.046 | |
31 | M. fortuitum | M. fortuitum | 2.169 | 64 | M. gastri | M. gastri | 2.270 | |
32 | M. fortuitum | M. fortuitum | 2.643 | 65 | No mycobacteria | M. elephantis | 1.744 | elephantis |
33 | M. fortuitum | M. fortuitum | 2.223 | 66 | Mycobacterium sp. | Unidentified | duvalii |
1 M. intracellulare/M. chimaera.
2M. scrofulaceum/parascrofulaceum.