TABLE 5.
Variants with potential NS5B resistance-associated amino acid positions
| Patient IDa | GTb | RAVc |
|||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NI |
NNI |
RBV |
|||||||||||||||||||||||||
| L159any | S282any | C289any | L320any | V321any | S96any | N142T | C316any | M414I/T/V | L419any | R422K | M423any | C445F | Y448any | Y452any | I482any | A486any | V494A | P495any | P496S | A499A | G554S | S556G | D559G | T390I | F415Y | ||
| A | 1a | A | |||||||||||||||||||||||||
| B | 1b | Y | |||||||||||||||||||||||||
| C | 2a | M | I | F | L | A | A | G | Y | ||||||||||||||||||
| D | 2b | M | I | F | L | A | A | G | Y | ||||||||||||||||||
| E | 2b | M | I | F | L | A | A | G | Y | ||||||||||||||||||
| F | 2c | M | I | F | L | A | A | S | G | Y | |||||||||||||||||
| G | 2c | M | I | F | L | A | A | S | G | Y | |||||||||||||||||
| H | 2j | M | V | F | L | A | A | G | Y | ||||||||||||||||||
| I | 3a | F | I | F | L | A | G | Y | |||||||||||||||||||
| J | 3i | F | I | F | L | A | G | Y | |||||||||||||||||||
| K | 4a | F | V | I | F | L | A | G | Y | ||||||||||||||||||
| L | 4d | F | I | I | F | L | A | G | Y | ||||||||||||||||||
| M | 5a | M | I | F | A | G | Y | ||||||||||||||||||||
| N | 6a | M | I | F | L | G | A | A | |||||||||||||||||||
| O | 6a | M | I | F | L | G | A | A | |||||||||||||||||||
| P | 6e | L | I | F | L | A | A | Y | |||||||||||||||||||
| Q | 6j | M | I | F | L | A | A | Y | |||||||||||||||||||
ID, identification.
GT, genotype.
Substitutions show positions in NS5B gene and their wild-type amino acid first (from 1a H77 reference genome) and the amino acid(s) associated with resistance second. For each patient, the presence of amino acids associated with resistance is shown in the table. Blank cells indicate identical amino acid as that of 1a wild type, which has not been associated with resistance. NI, nucleoside inhibitor; NNI, non-nucleoside inhibitor; RBV, ribavirin.