Table I.
DNA sequences of all primers used in methylation sensitive polymerase chain reaction.
Gene | Direction | Methylated primer | Unmethylated primer |
---|---|---|---|
APC | F | 5′-TATTGCGGAGTGCGGGTC-3′ | 5′-GTGTTTTATTGTGGAGTGTGGGTT-3′ |
R | 5′-TCGACGAACTCCCGACGA-3′ | 5′-CCAATCAACAAACTCCCAACAA-3′ | |
CASP8 | F | 5′-TAGGGGATTCGGACATTGCGA-3′ | 5′-TAGGGGATTTGGAGATTGTGTA-3′ |
R | 5′-CGTATATCTACATTCGAAACG-3′ | 5′-CCATATATATCTACATTCAAAACAA-3′ | |
CCND1 | F | 5′-TACGTGTTAGGGTCGATCG-3′ | 5′-GTTATGTTATGTTTGTTGTATG-3′ |
R | 5′-CGAAATATCTACGCTAAACG-3′ | 5′-TAAAATCCACCAACACAATCA-3′ | |
FHIT | F | 5′-TTGGGGCGCGGGTTTGGGTTTTTACGC-3′ | 5′-TTGGGGTGTGGGTTTGGGTTTTTATG-3′ |
R | 5′-CGTAAACGAGCGCGACCCCACTA-3′ | 5′-CATAAACACCAACCCCACTA-3′ | |
MTSS1 | F | 5′-GAGAGCGCGTTTTCGTTTGGC-3′ | 5′-GAGAGTGTGTTTTTGTTTGGT-3′ |
R | 5′-CGCCTCCTTTTCACTCCTACG-3′ | 5′-CCACCTCCTTTTCACTCCTACA-3′ | |
p16 | F | 5′-TTATTAGAGGGTGGGGCGGATCGC-3′ | 5′-TTATTAGAGGGTGGGGTGGATTGT-3′ |
R | 5′-ACCCCGAACCGCGACCGTAA-3′ | 5′-CAACCCCAAACCACAACCATAA-3′ | |
RASSF1a | F | 5′-GTGTTAACGCGTTGCGTATC-3′ | 5′-TTTGGTTGAGTGTGTTAATGTG-3′ |
R | 5′-AACCCCGCGAACTAAAAACGA-3′ | 5′-CAAACCCCACAAACTAAAAACAA-3′ | |
RB1 | F | 5′-GGGAGTTTCGCGGACGTGAC-3′ | 5′-GGGAGTTTTGTGGATGTGAT-3′ |
R | 5′-ACGTCGAAACACGCCCCG-3′ | 5′-ACATCAAAACAACCCCA-3′ |
F, forward; R, reverse.