Table 2.
Tropomyosin 1 gene RNA isoform expression in breast cancer cell lines.
| Cell line | RNA isoform expression▲ | ||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| TMP1α | TPM1β | TPM1γ | TPM1δ | TMP1ε | TPM1ζ | TPM1η | TPM1θ | TPM1ι | TPM1κ | TPM1λ | TPM1μ | TPM1ν | TPM1ξ | GAPDH | |
| Breast cancer | |||||||||||||||
| HCC 1143∗ | − | + | +++ | ++ | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | ++++ |
| HCC 1187∗ | − | + | +++ | ++ | − | − | − | − | − | − | ++ | + | − | − | ++++ |
| BT 474 | − | + | +++ | ++ | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | ++++ |
| mDAMB 157 | − | + | +++ | ++ | − | − | − | − | − | − | + | + | ++ | − | ++++ |
| HCC 1806 | − | − | ++ | + | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | ++++ |
| HCC 1419∗ | − | + | ++ | ++ | − | − | − | − | − | − | + | − | + | − | ++++ |
| mDAMB 453 | − | − | ++ | + | − | − | − | − | − | − | ++ | − | + | − | ++++ |
| mDAMB 468 | − | + | +++ | ++ | − | − | − | − | − | − | + | + | + | − | ++++ |
| MCF7 | − | − | +++ | + | − | − | − | − | − | − | ++ | − | − | − | ++++ |
|
| |||||||||||||||
| MCF10A (normal breast) | − | + | +++ | ++ | − | − | − | − | − | − | − | + | + | + | ++++ |
| HCC 1143 (BL)+ | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | ++++ |
| HCC 1143 (BL)+ | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | ++++ |
| Adult heart | ++++ | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | ++++ |
| Fetal heart | +++ | − | − | − | − | − | − | − | − | ++ | − | − | − | − | ++++ |
▲ = cell lines were analyzed by RNA-PCR for the indicated TPM1 isoforms. GAPDH RNA was analyzed as a control for baseline RNA expression. Expression was qualitatively recorded as either negative (−) or plus (+) to four pluses (++++).
∗ = primary tumor; the rest were metastatic tumors.
+BL = B-lymphocyte cell lines.